这是一款名为 SuRankCo 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以作为 surankco_r5.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 SuRankCo 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SuRankCo 在 Linux 上在线运行
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商品描述
SuRankCo 是一种基于机器学习的软件，用于对来自下一代测序数据的从头组装的重叠群进行评分和排序。 它训练具有已知参考基因组的重叠群的比对，并预测尚无相关参考基因组的重叠群的分数和排名。有关 SuRankCo 及其运作的更多详细信息，请参阅
“SuRankCo：从头组装中对重叠群的监督排序”
Mathias Kuhring、Piotr Wojtek Dabrowski、Andreas Nitsche 和 Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
请注意，建议在使用 SuRankCo 之前阅读论文和 readme.txt 文件。
2015 年 XNUMX 月更新：
* 小改动以启用 BAM 支持。
2014 年 XNUMX 月更新：
* 除了 ACE/FASTQ(QUAL) 之外，还增加了对 FASTA/SAM 程序集的支持。
注意：FASTA/SAM 组件的功能还不包括 BaseCount、BaseSeqmentCount 和 ContigQualities。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
爪哇，S/R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/surankco/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
