Windows 版 clusterProfiler 下载

这是名为 clusterProfiler 的 Windows 应用程序,其最新版本可以下载为 clusterProfilersourcecode.tar.gz。它可在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。

 
 

使用 OnWorks 免费下载并在线运行此名为 clusterProfiler 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序并安装。

- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。

Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。

截图:


集群分析器


描述:

clusterProfiler 是一个 R/Bioconductor 软件包,它提供了统一的功能富集分析工作流程,以解释高通量组学结果。它支持过度表达分析和基因集富集分析,让您可以处理未排序的基因列表或来自差异化流程的排序统计数据。该软件包通过一致的界面连接到多个知识库,例如基因本体 (Gene Ontology)、KEGG、Reactome、疾病本体 (Disease Ontology)、MeSH 等,让您无需重写代码即可查询不同的生物学视角。它以广度为设计目标,通过利用持续更新的注释,涵盖编码和非编码特征以及数千种生物体。结果以简洁、易于操作的结构返回,并与丰富的可视化功能(通过配套工具)自然搭配,以总结通路、术语和基因集关系。



功能

  • 跨多个注释源的统一 ORA 和 GSEA 工作流程
  • 使用最新基因注释提供广泛的物种支持
  • 整洁的输出,与下游 R 数据管道清晰集成
  • 通过配套绘图工具内置可视化富集结果
  • 用于跨条件分析的多组比较实用程序(例如 compareCluster)
  • 可重复的端到端富集研究的详细插图和手册


程式语言

R


分类

数据分析

此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最便捷的方式在线运行。



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