这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一（例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器）在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 domainsee
程序：
您的姓名
domainse - 将二级结构记录添加到 DCF 文件。
概要
域名 -dcfin文件 入档 -dccfdir 目录 -dc输出文件 输出文件 -日志文件 输出文件
域名 -救命
商品描述
域名 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学公开赛”）的命令行程序
软件套件”）。 它是“Utils:Database creation”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-dcfin文件 入档
此选项指定 DCF 文件（域分类文件）（输入）的名称。 一种
“域分类文件”包含来自域的分类和其他数据
SCOP 或 CATH，采用 DCF 格式（类似于 EMBL）。 这些文件是使用 SCOPPARSE 生成的
和 CATHPARSE。 可以通过使用将域序列信息添加到文件中
域。
-dccfdir 目录
此选项指定域 CCF 文件的位置（干净的坐标文件）
（输入）。 “干净的坐标文件”包含蛋白质坐标和衍生数据
单个 PDB 文件（“蛋白质清洁坐标文件”）或来自 SCOP 或 CATH 的单个域
（“域清洁坐标文件”），采用 CCF 格式（类似于 EMBL）。 生成的文件
使用 PDBPARSE（PDB 文件）或 DOMAINER（域），包含“清理”的数据
自洽和纠错。 残留溶剂可及性记录和
使用 PDBPLUS 将二级结构添加到文件中。 默认值： 。/
其他要求 部分
高级 部分
输出 部分
-dc输出文件 输出文件
此选项指定 DCF 文件（域分类文件）的名称
二级结构记录（输出）。 “域分类文件”包含
来自 SCOP 或 CATH 的域的分类和其他数据，采用 DCF 格式
（类似于 EMBL）。 这些文件是使用 SCOPPARSE 和 CATHPARSE 生成的。 域序列
可以使用 DOMAINSEQS 将信息添加到文件中。
-日志文件 输出文件
此选项指定 DOMAINSSE 日志文件的名称。 默认值：domainsse.log
使用 domainsee 使用 onworks.net 服务在线查看