fsl-5.0-core - 云端在线

这是命令 fsl-5.0-core 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

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fsl - 用于 FMRI、MRI 和 DTI 脑成像的分析工具

商品描述


FSL 是用于分析医学脑成像数据的综合工具包。 它
提供用于数据预处理、大脑提取、图像配准以及
广泛的统计分析。 FSL 提供易于使用的 GUI。

FSL 需要正确设置许多环境变量。 为达到这个,
请从 /etc/fsl/5.0/fsl.sh 获取配置脚本。 一种方法来做到这一点
自动是添加一行包含

。 /etc/fsl/5.0/fsl.sh

到用户主目录中的 .bashrc 文件(或其他 shell 的相应文件
比 bash)。 您可能需要先创建这样的文件。

或者,Debian 软件包为所有 FSL 工具安装符号链接 / usr / bin
负责自动加载适当的配置。 符号链接名称是
以相应的前缀 FSL 版本以防止文件名冲突并允许
多个版本共存于同一系统。 例如, 切片机 命令是
可作为 fsl5.0-切片器. 请注意,使用 FSL 通过这些符号链接的工具是
不能 执行上述设置过程所必需的。 然而,这种便利
特性是 Debian 特有的。 使用 FSL 命令并打算共享的脚本
与其他人应该依赖于不带前缀的命令名称和 FSL 环境变量
设置。

FSL 用户界面有时指的是 文件目录. 在 Debian 系统上,这是
/usr/共享/fsl/5.0 对于 FSL 5.0 版。

FSL 文档和在线帮助由 fsl-5.0-文档 包。

关于使用的问题 FSL 或者相关的理论可以张贴在 FSL 邮件
名单 (见 http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).

平行化


FSL 可以配置为将作业提交给正在运行的 Sun Gridengine (SGE)。 虽然不是全部
在 FSL 中实现的功能支持这种并行化,最苛刻的
处理工具(例如 POSSUM 和 FDT)。

即使未设置 SGE_ROOT 环境变量,FSL 也应该能够使用 SGE,如
以 SGE 的 Debian 软件包为例。 要启用批处理只需设置

FSL平行=1

在运行 FSL 的 shell 中。 这可以在

/etc/fsl/5.0/fsl.sh

或视具体情况而定。

使用 onworks.net 服务在线使用 fsl-5.0-core



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