这是命令 infoaligne，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
infoalign - 显示关于多序列比对的基本信息
概要
信息对齐 -序列 序列集 [-矩阵 矩阵[-refseq 绳子] -复数 浮动
-身份 浮动 -输出文件 输出文件 [-html 布尔] -只要 布尔 -标题 布尔
-美国 布尔 -芋头 布尔 -seqlength 布尔 -对齐长度 布尔 -差距 布尔
-差距 布尔 -id计数 布尔 -simcount 布尔 -差异计数 布尔
-更改 布尔 -重量 布尔 -描述 布尔
信息对齐 -救命
商品描述
信息对齐 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学公开赛”）的命令行程序
软件套件”）。 它是“对齐：多个，数据检索：序列数据”的一部分
命令组。
配置
输入 部分
-序列 序列集
要显示的序列比对。
-矩阵 矩阵
这是比较序列时使用的评分矩阵文件。 默认情况下它是
文件“EBLOSUM62”（用于蛋白质）或文件“EDNAFULL”（用于核酸序列）。 这些
文件位于 EMBOSS 安装的“data”目录中。
-refseq 绳子
如果您在比对中给出编号或序列名称，它将被视为
成为参考序列。 参考序列是所有的
其他序列进行比较。 如果将其设置为 0，则共有序列将是
用作参考序列。 默认情况下，共有序列用作
参考序列。
先进的 部分
-复数 浮动
为正得分匹配的百分比设置截止值，低于该值没有达成共识。
默认的复数取所有序列总权重的 50%
结盟。 默认值：50.0
-身份 浮动
提供在一个位置设置所需数量的身份的便利
它给出一个共识。 因此，如果将其设置为 100%，则仅标识列
为共识做出贡献。 默认值：0.0
输出 部分
-输出文件 输出文件
如果您在此处输入文件名，则该程序将写入序列详细信息
进入那个文件。
-html 布尔
默认值：N
-只要 布尔
如果您只想要一些东西，这是一种缩短命令行的方法
显示。 而不是指定：'-nohead -nousa -noname -noalign -nogaps -nogapcount
-nosimcount -noidcount -nodiffcount -noweight' 仅获取序列长度输出，
您可以指定 '-only -seqlength' 默认值：N
-标题 布尔
默认值：@(!$(only))
-美国 布尔
默认值：@(!$(only))
-芋头 布尔
默认值：@(!$(only))
-seqlength 布尔
默认值：@(!$(only))
-对齐长度 布尔
默认值：@(!$(only))
-差距 布尔
默认值：@(!$(only))
-差距 布尔
默认值：@(!$(only))
-id计数 布尔
默认值：@(!$(only))
-simcount 布尔
默认值：@(!$(only))
-差异计数 布尔
默认值：@(!$(only))
-更改 布尔
默认值：@(!$(only))
-重量 布尔
默认值：@(!$(only))
-描述 布尔
默认值：@(!$(only))
使用 onworks.net 服务在线使用 infoaligne
