这是一个名为 Kinannote 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Kinannote_1.0.tar。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Kinannote 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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基南诺特
商品描述
Kinannote 使用源自丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的 HMM、源自 HMM 的位置特定评分矩阵,并与来自本地版本的精选激酶数据库进行比较,识别和分类用户提供的 fasta 文件中的蛋白激酶 激酶网站. 如果用户输入完整的蛋白质组,附加模块会评估激酶组的完整性并将其置于参考激酶组的上下文中。 Kinannote 在 unix 命令行上运行并依赖于本地 hmmer 2 和 Blast 2.24 安装。
引用 Kinannote:
Kinannote,一种用于识别和分类真核蛋白激酶超家族成员的计算机程序
乔纳森·M·戈德堡; 艾莉森·格里格斯; 珍妮特·L·史密斯; 布赖恩·哈斯; 詹妮弗·沃特曼; 曾乾东
生物信息学 2013; doi:10.1093/生物信息学/btt419
HTTP: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full
pdf: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2387.full.pdf+html
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/kinannote/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。