适用于 Linux 的 MetaPhat -meta-pheno-association-tracker 下载

这是名为 MetaPhat -meta-pheno-association-tracker 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 meta_phat.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

 
 

使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 MetaPhat -meta-pheno-association-tracker 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

截图:


MetaPhat-元表型关联跟踪器


描述:

MetaPhat 是一个活跃的开源(MIT 许可)工具,通过使用来自单变量 GWAS 研究的汇总统计数据来检测具有多变量关联的变体。 该应用程序还通过查找多变量潜在客户变量的最佳 BIC 子集和 P 值驱动程序特征来执行分解。 对变异结果进行追踪和聚类,以帮助剖析表型-基因型关系。

请参阅我们的 wiki 主页以获取安装说明、所需的 GWAS 数据格式和使用测试命令的示例输入 - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/

全球脂质(GLGC,Willer 2013)数据/源焦油示例 - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download

如果您在尝试示例和阅读教程后遇到问题或有功能请求,请发送电子邮件: jake.lin@helsinki.fi

版权所有 <2019> jake.lin@helsinki.fi, matti.pirinen@helsinki.fi

特征

  • 多变量全基因组性状分析
  • 基于 p 值和 BIC 的最优性状子集选择
  • 性状分解轨迹图
  • 主要 SNP 和驱动程序特征摘要文件
  • snp-snp 特质等级 spearman 集群


这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。



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