这是名为 PTESFinder 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 ptesfinder_v1.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 PTESFinder 和 OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
PTES查找器
描述：
PTESFinder 是一种用于从高通量 RNAseq 数据中识别转录后外显子改组事件的计算管道。 PTESFinder 利用已建立的 RNASeq 工具的强大功能，通过应用专门针对这些假阳性而设计的严格过滤器，系统地排除所有已知类别的假阳性结构。 PTESFinder 将映射到假定 PTES 结构的读数的比对质量与映射到基因组区域和规范拼接转录本时相同读数的质量进行比较。 这种方法增加了对 PTES 支持读取的信心。 当与转录组对齐时，源自模板切换事件的读取通常以大插入缺失为特征。 PTESFinder 使用额外的过滤器来排除在 PTES 外显子-外显子连接点周围对齐不明确的读取，进一步增加对这些支持读取的信心。 PTESFinder 比其他公开的方法识别出更多的 PTES 结构，同时保持高特异性。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Unix 外壳，Java
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。