这是一个名为 Visualization of Protein-Ligand Graphs 的 Windows 应用程序，可在 Windows 上在线运行于 Linux 在线，其最新版本可以下载为 vplg_2016_07_18.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 Visualization of Protein-Ligand Graphs 的应用程序，可通过 OnWorks 免费在线在 Windows 上运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
截图：
蛋白质-配体图的可视化，可在 Windows 上在线运行于 Linux 在线
描述：
蛋白质配体图 (VPLG) 软件包的可视化计算和可视化蛋白质图。 它适用于超二级结构级别，并使用来自 PDB 文件的原子坐标和 DSSP 算法的 SSE 分配。VPLG 是命令行软件。 如果您不喜欢输入命令，请尝试我们的 PTGL Web 服务器： http://ptgl.uni-frankfurt.de/
特性
- 从 PDB 文件中读取 3 维原子数据并从 DSSP 文件中读取二级结构分配
- 根据数据计算蛋白质配体图并可视化该图
- 支持以位图 (.png) 和矢量 (.svg) 格式输出图形图像
- 以自己的格式 (.plg) 导出纯文本文件中的蛋白质配体图形，该格式易于使用计算机程序以及多种标准图形文件格式进行编辑、解析和生成
- 可以从 .plg 文件读取并直接可视化蛋白质图
- 免费开源软件 (FOSS)
- 数据库支持（完全可选，默认不需要数据库服务器）
- 命令行界面允许通过 shell 脚本轻松进行批处理
- 允许按原子数过滤配体
- 用 Java 编写的新 GUI，不再需要键入控制台命令！
- 支持 PTGL Web 服务器的软件： http://ptgl.uni-frankfurt.de/
目的
科学/研究、教育、高级最终用户
用户界面
Java Swing、控制台/终端、命令行
程式语言
爪哇岛
数据库环境
数据库连接
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/vplg/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。