fastaq-sequence_trim - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

fastaq_sequence_trim - قطع المطابقات التامة لسلسلة معينة من بداية كل منها
تسلسل

الوصف

الاستخدام: fastaq_sequence_trim [خيارات]


يقوم بقص التسلسلات من بداية كافة التسلسلات في زوج من ملفات التسلسل، كلما كان هناك
هي مباراة مثالية. يحتفظ فقط بزوج القراءة إذا كانت كلتا قراءتي الزوج على الأقل
الحد الأدنى للطول بعد أي تشذيب

الموضعية الحجج:
infile_1
اسم الملف fasta/q إلى الأمام المراد قطعه

infile_2
اسم ملف fasta/q العكسي المراد قطعه

outfile_1
اسم الإخراج إلى الأمام fasta/q الملف

outfile_2
اسم الإخراج العكسي fasta/q الملف

Trim_seqs
اسم ملف التسلسلات المطلوب البحث عنها في بداية كل تسلسل إدخال

اختياري الحجج:
-h, --مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج

--طول دقيقة INT
الحد الأدنى لطول تسلسلات الإخراج [50]

- ريفكومب
قم بقص نهاية كل تسلسل إذا كان يطابق المكمل العكسي. هذا الخيار هو
مخصص لتقليم التمهيدي PCR

استخدم fastaq-sequence_trim عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net