mia-3dmotioncompica-nonrigid - عبر الإنترنت في السحابة

هذا هو الأمر mia-3dmotioncompica-nonrigid الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت

برنامج:

اسم


mia-3dmotioncompica-nonrigid - تسجيل غير خطي لسلسلة من الصور ثلاثية الأبعاد.

موجز


mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [خيارات]

الوصف


mia-3dmotioncompica-nonrigid ينفذ هذا البرنامج نسخة ثلاثية الأبعاد من الحركة
خوارزمية التعويض الموصوفة في Wollny G ، Kellman P ، Santos A ، Ledesma-Carbayo MJ ،
"التعويض التلقائي للحركة للتنفس الحر حصل على بيانات نضح عضلة القلب بواسطة
باستخدام تحليل المكونات المستقلة "، تحليل الصور الطبية ، 2012 ،
دوى:10.1016/j.media.2012.02.004.

OPTIONS


ملف IO
-أنا في ملف = (إدخال ، مطلوب) ؛ io
صور الإدخال للملفات المرقمة على التوالي (nameXXXX.ext) للدعم
راجع أنواع الملفات المكونات الإضافية: 3dimage / io

-o --out-file = (الإخراج ، مطلوب) ؛ io
اسم صورة الإخراج (كسلسلة بتنسيق C تتضمن %04d من أجل التحديد
ترقيم الملفات) للتعرف على أنواع الملفات المدعومة، راجع PLUGINS:3dimage/io

- حفظ المراجع =
حفظ الصور المرجعية، يتم استخدام السلسلة المحددة كأساس لاسم الملف، و
يتبع نمط الأرقام الصور المدخلة، ويكون تنسيق الإخراج دائمًا
'مشهد من خلال'

- حفظ - ريجس =
حفظ الصور المسجلة المتوسطة، يتم استخدام السلسلة المحددة كاسم ملف
القاعدة، يتبع نمط الأرقام الصور المدخلة، ويكون تنسيق الإخراج هو
دائما "فيستا"

--save-coeffs=
حفظ مصفوفة الخلط في ملف نصي

--save-features=
حفظ الصور المميزة بصيغة PNG

المساعدة & معلومات
-V - الإفراط في الكلام = تحذير
الإسهاب في الإخراج ، وطباعة الرسائل ذات المستوى المحدد والأولويات الأعلى.
الأولويات المدعومة التي تبدأ من أدنى مستوى هي:
info - رسائل منخفضة المستوى
تتبع - تتبع استدعاء الوظيفة
فشل - الإبلاغ عن إخفاقات الاختبار
تحذير - تحذيرات
خطأ - الإبلاغ عن الأخطاء
تصحيح - إخراج التصحيح
الرسالة - رسائل عادية
مميت - الإبلاغ عن الأخطاء الفادحة فقط

--حقوق النشر
طباعة معلومات حقوق النشر

ح- مساعدة
اطبع هذه التعليمات

-؟ --استخدام
اطبع تعليمات قصيرة

--الإصدار
اطبع رقم الإصدار واخرج

ICA
-C - المكونات = 0
مكونات ICA 0 = تقدير تلقائي مكونات ICA 0 = تلقائي
تقدير

- لا تطبيع
لا تطبيع المرحلية

--لا خط الوسط
لا تجرد الوسط من منحنيات الاختلاط

-k - تخطي = 0
تخطي الصور في بداية السلسلة ، على سبيل المثال لأنها صور أخرى
modalitiesskip الصور في بداية السلسلة ، على سبيل المثال لأنها
هي من طرائق أخرى

-m - max-ica-iter = 400
الحد الأقصى لعدد التكرارات في ICA الحد الأقصى لعدد التكرارات في ICA

اﻟﻤﻌﺎﻟﺠﺔ
- الخيوط = -1
الحد الأقصى لعدد الخيوط المراد استخدامها للمعالجة ، يجب أن يكون هذا الرقم أقل
أو يساوي عدد نوى المعالج المنطقي في الجهاز. (-1:
تقدير تلقائي). عدد الخيوط المستخدمة في المعالجة ، هذا
يجب أن يكون الرقم أقل أو مساويًا لعدد نوى المعالج المنطقي في
الآلة. (-1: تقدير تلقائي).

التسجيل
-O - ​​المُحسِّن = gsl: opt = gd ، الخطوة = 0.1
مُحسِّن يستخدم للتقليل

- معدل البدء ج = 32
معدل معامل البدء في العمود الفقري ، يتم تقسيمه على - c-rate-divider with
يتم تقسيم كل معدل معاملات مرور في العمود الفقري على مقسم معدل c
مع كل تمريرة

--c-rate-divider = 4
مقسم معدل القهوة لكل مقسم معدل كفاءة المرور لكل تمريرة

-d --start-divcurl = 20
بدء divcurl weight ، يتم تقسيمها على divcurl-divider مع كل مرور
divcurl weight ، يتم تقسيمها بواسطة - divcurl-divider مع كل تمريرة

- divcurl-divider = 4
تحجيم الوزن divcurl مع كل قياس جديد للوزن passdivcurl مع كل منها
تمريرة جديدة

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
تكلفة الصورة

-ل - مستويات ملغ = 3
مستويات دقة متعددةمستويات دقة متعددة

-P - التمريرات = 3
يمر التسجيل

المكونات الإضافية: 3dimage / io


تحليل تحليل 7.5 صورة

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .HDR ، .hdr

أنواع العناصر المدعومة:
بدون إشارة 8 بت ، توقيع 16 بت ، توقيع 32 بت ، نقطة عائمة 32 بت ،
النقطة العائمة 64 بت

داتابول IO الظاهري من وإلى تجمع البيانات الداخلي

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها:. @

ديكوم سلسلة صور Dicom ثلاثية الأبعاد

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .DCM ، .dcm

أنواع العناصر المدعومة:
توقيع 16 بت ، 16 بت بدون توقيع

hdf5 HDF5 صورة ثلاثية الأبعاد IO

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: H5، .h5

أنواع العناصر المدعومة:
بيانات ثنائية ، موقعة 8 بت ، بدون إشارة 8 بت ، موقعة 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ،
توقيع 32 بت ، بدون توقيع 32 بت ، توقيع 64 بت ، بدون توقيع 64 بت ، عائم
النقطة 32 بت ، النقطة العائمة 64 بت

inria صورة INRIA

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .INR ، .inr

أنواع العناصر المدعومة:
توقيع 8 بت ، بدون توقيع 8 بت ، توقيع 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ، 32 بت
بت ، بدون إشارة 32 بت ، النقطة العائمة 32 بت ، النقطة العائمة 64 بت

MHD MetaIO 3D image IO باستخدام تطبيق VTK (تجريبي).

امتدادات الملفات المعترف بها: .MHA ، .MHD ، .mha ، .mhd

أنواع العناصر المدعومة:
توقيع 8 بت ، بدون توقيع 8 بت ، توقيع 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ، 32 بت
بت ، بدون إشارة 32 بت ، النقطة العائمة 32 بت ، النقطة العائمة 64 بت

نيفتي صورة NIFTI-1 ثلاثية الأبعاد IO

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .NII ، .nii

أنواع العناصر المدعومة:
توقيع 8 بت ، بدون توقيع 8 بت ، توقيع 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ، 32 بت
بت ، بدون إشارة 32 بت ، توقيع 64 بت ، بدون توقيع 64 بت ، نقطة عائمة 32
بت ، النقطة العائمة 64 بت

فف تنسيق VFF Sun النقطية

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .VFF ، .vff

أنواع العناصر المدعومة:
8 بت غير موقعة ، 16 بت

فيستا عرض ثنائي الأبعاد

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .V ، .VISTA ، .v ، .vista

أنواع العناصر المدعومة:
بيانات ثنائية ، موقعة 8 بت ، بدون إشارة 8 بت ، موقعة 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ،
توقيع 32 بت ، بدون إشارة 32 بت ، النقطة العائمة 32 بت ، النقطة العائمة 64
بت

VTI إدخال وإخراج VTK-XML للصور ثلاثية الأبعاد (تجريبي).

امتدادات الملفات المعترف بها: .VTI، .vti

أنواع العناصر المدعومة:
توقيع 8 بت ، بدون توقيع 8 بت ، توقيع 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ، 32 بت
بت ، بدون إشارة 32 بت ، النقطة العائمة 32 بت ، النقطة العائمة 64 بت

فتق إدخال وإخراج صورة ثلاثية الأبعاد VTK (تجريبي).

امتدادات الملفات التي تم التعرف عليها: .VTK ، .VTKIMAGE ، .vtk ، .vtkimage

أنواع العناصر المدعومة:
بيانات ثنائية ، موقعة 8 بت ، بدون إشارة 8 بت ، موقعة 16 بت ، بدون توقيع 16 بت ،
توقيع 32 بت ، بدون إشارة 32 بت ، النقطة العائمة 32 بت ، النقطة العائمة 64
بت

مثال


قم بتسجيل سلسلة التروية الواردة في الصور imageXXXX.v باستخدام ICA من الفئة 4
تقدير. تخطي صورتين في البداية، استخدم 4 مواضيع تسجيل على الأكثر، nlopt
المحسن القائم وغير ذلك يستخدم المعلمات الافتراضية. قم بتخزين النتيجة في
مسجلXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i Images0000.v -o مسجل%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

المؤلفون)


جيرت وولني

حقوق الطبع والنشر


هذا البرنامج خاضع لحقوق الطبع والنشر (ج) 1999-2015 لايبزيغ ، ألمانيا ومدريد ، إسبانيا. يأتي
بدون ضمان مطلقًا ويمكنك إعادة توزيعه وفقًا لبنود GNU
الترخيص العام العام الإصدار 3 (أو أحدث). لمزيد من المعلومات ، قم بتشغيل البرنامج بامتداد
الخيار "- حقوق النشر".

استخدم mia-3dmotioncompica-nonrigid عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net



أحدث برامج Linux و Windows عبر الإنترنت