com.xcrysden
هذا هو الأمر xcrysden الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
xcrysden - متخيل التركيب البلوري والجزيئي
موجز
com.xcrysden [خيارات خاصة]
com.xcrysden [خيارات خاصة] خيارات التنسيق ملف|دليل
الوصف
XCrySDen هو برنامج تصور التركيب البلوري والجزيئي ، والذي يهدف إلى
عرض الأسطح المتساوية والملامح ، والتي يمكن فرضها على الهياكل البلورية
وتدويرها ومعالجتها بشكل تفاعلي.
خاص OPTIONS
-h
--مساعدة
عرض رسالة المساعدة.
-v
--الإصدار
عرض معلومات إصدار البرنامج.
-u id
--استعمال id
تحميل XCrySDen مدمج في نافذة الحاوية مع معرف النافذة =id.
-r أح
- مخفض أح
تقليل البعد الدوري لملف XSF إلى أح. يجب تحديده من قبل --xsf اختيار،
على سبيل المثال، com.xcrysden -r 2 --xsf ملف.
-c ملف
--مخصص ملف
تحميل تعريفات مخصصة من ملف محدد (الصيغة هي تلك الخاصة بـ
~ / .xcrysden / تعريفات مخصصة).
-a ملف
--صفات ملف
سمات التحميل من الملف. تنسيق ملف السمات هو كما يلي:
عنصر
العدد الذري 1 red1 blue1 green1
العدد الذري 2 red2 blue2 green2
إليمينتراديوس
العدد الذري 1 نصف القطر 1
العدد الذري 2 نصف القطر 2
-l ملف
--أضواء ملف
تحميل معلمات الأضواء من ملف تنسيق أضواء XCrySDen.
FORMAT OPTIONS
--xsf ملف
هيكل التحميل من ملف بتنسيق XCrySDen's-Structure-File (XSF).
--animxsf ملف
--axsf ملف
تحميل الهياكل من ملف بتنسيق Animated-XCrySDen's-Structure-File (AXSF).
--bxsf ملف
قم بتحميل نطاقات من ملف BXSF (Band-XSF) وقم بتصور Fermi Surface.
- xmol ملف
--xyz ملف
هيكل التحميل من ملف بتنسيق XYZ.
--pdb ملف
تحميل هيكل من ملف PDB منسق.
- غزمات ملف
هيكل التحميل من Gaussian Z-matrix (يتطلب برنامج Open-Babel).
--غوسيان_آوت ملف
- gxx_out ملف
--g98_out ملف
هيكل التحميل من ملف الإخراج Gaussian. فقط حساب نقطة واحدة و
تشغيل التحسين مدعوم حتى الآن. من أجل تشغيل التحسين ، من الممكن أن
تقديم جميع الهياكل التي تم إنتاجها أثناء التشغيل.
--مكعب ملف
- gXX_cube ملف
--g98_cube ملف
هيكل التحميل من ملف المكعب Gaussian. يجب أن يتم إنتاج ملف المكعب بامتداد
مكعب = خيار البطاقات. يتم دعم ملفات المكعب الحجمي فقط ، أي Cube = (البطاقات ، الكثافة)
أو المكعب = (البطاقات ، المدارات) أو المكعب = (البطاقات ، المحتملة). الرجوع إلى دليل GAUSSIAN للحصول على
معنى هذه الكلمات الرئيسية.
--crystal_inp ملف
هيكل الحمل من CRYSTAL (http://http: //www.crystal.unito.it/) ملف الإدخال.
- Crystal_f9 ملف
هيكل الحمل من CRYSTAL (http://http: //www.crystal.unito.it/) وحدة فورتران 9.
--wien_struct ملف|ملف|دليل
هيكل التحميل من WIEN2k (http://www.wien2k.at/) Struct-file ، حيث:
ملف = اسم ملف الهيكل بدون .struct تمديد،
ملف = اسم الملف ،
دليل = اسم دليل الحالة.
--wien_kpath دليل|منظم ملف
عرض البنية ملف وتقديم منطقة Brillouin الأولى بنقاط k الخاصة. يمكن أن يكون المسار K
تم تحديدها بشكل تفاعلي عن طريق النقر بالماوس على نقاط k الخاصة. يجب على المستخدم تحديد أمين
و EMAX الطاقات والعدد الإجمالي للنقاط k على طول المسار. هذا الرقم هو مجرد
تقدير العدد الإجمالي للنقاط k ، لأن XCrySDen يحاول الحصول على موحد للغاية
أخذ عينات من نقاط k على طول المسار (لا تحدد WIEN2k أقصى عدد مسموح به من k-
من النقاط ، نظرًا لأن XCrySDen قد يولد نقاطًا قليلة أكثر).
--wien_renderdensity دليل
عرض البنية, الناتجو رو ملفات ويجعل هيكل بلوري ومحسوبة مسبقا
كثافة الشحنة.
- كثافة_واين ديري
يتم اختيار المنطقة ثنائية الأبعاد أو ثلاثية الأبعاد لحساب كثافة الشحنة بشكل تفاعلي بواسطة
النقر بالماوس. يولد XCrySDen in5 ملف (ملفات) ، يحسب ويعرض كثافة الشحن
إما على شكل عزل / ألوان (2D) أو أسطح متساوية (3D).
--wien_fermisurface دليل
نافذة مهمة منبثقة لإنشاء سطح Fermi. بعد عدة خطوات من Fermi
يتم رسم السطح (نأمل) باعتباره سطحًا متساويًا ثلاثي الأبعاد.
--fhi_inpini ملف
هيكل الحمل من FHI98MD inp.ini ملف منسق.
--fhi_coord ملف
هيكل الحمل من FHI98MD تنسيق ملف منسق.
--pwi
--pw_inp ملف
هيكل التحميل من pw.x. إدخال ملف. pw.x. هو برنامج Planewave ذو القدرة الزائفة لـ
توزيع Quantum-ESPRESSO (http://www.quantum-espresso.org/).
--pwo
--pw_out ملف
هيكل التحميل من pw.x. الناتج ملف. pw.x. هو برنامج Planewave ذو القدرة الزائفة لـ
توزيع Quantum-ESPRESSO (http://www.quantum-espresso.org/).
-s سيناريو
--النصي سيناريو
تحميل البرنامج النصي من ملف يحتوي على نص Tcl النصي.
استخدم xcrysden عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net