هذا هو تطبيق Linux المسمى Gen3D الذي سيتم تشغيله في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم gen3d.cpp. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل هذا التطبيق المسمى Gen3D وتشغيله عبر الإنترنت للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
Gen3D للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
الوصف
Gen3D هو تطبيق مصمم لتحديد نماذج الجينوم والكروموسوم ثلاثية الأبعاد. يستخدم بيانات الاتصال الكروموسومية لبناء مطابقة ثلاثية الأبعاد. يمكن أن تولد هذه الطريقة نماذج كروموسومية ثلاثية الأبعاد ترضي جزءًا كبيرًا من ملامسات الكروموسومات.تم تطوير البرنامج في مختبر المعلوماتية الحيوية واستخراج البيانات والتعلم الآلي للبروفيسور جيانلين تشينج في قسم علوم الكمبيوتر في جامعة ميسوري - كولومبيا ، الولايات المتحدة الأمريكية. المشروع مدعوم من المؤسسة الوطنية للعلوم (المنحة رقم DBI1149224).
إذا كنت تستخدم Gen3D في بحثك ، فيرجى الاستشهاد بما يلي:
Nowotny ، جاكسون ، شريف أحمد ، Lingfei Xu ، Oluwatosin Oluwadare ، Hannah Chen ، Noelan Hensley ، Tuan Trieu ، Renzhi Cao ، و Jianlin Cheng. "إعادة البناء التكراري لنماذج ثلاثية الأبعاد للكروموسومات البشرية من بيانات الاتصال الصبغية." المعلوماتية الحيوية BMC 16 ، لا. 1 (2015): 338.
شرح المميزات:
- استخدم بيانات الاتصال الكروموسومية التي تم الحصول عليها باستخدام تقنية Hi-C
- بناء نماذج ثلاثية الأبعاد للجينوم والكروموسوم الهيكلي من بيانات الاتصال الكروموسومية
- قم بتهيئة الإحداثيات باستخدام النهج الاحتمالي
- طريقة جديدة لتمثيل جهات الاتصال الراضية في مصفوفة خريطة الحرارة
- مخططات تسجيل النقاط لمعرفة الاتصالات طويلة المدى وقصيرة المدى
- مقارنة بالطريقة الأخرى الموجودة وأيضًا تم التحقق من صحتها باستخدام ميزات الجينوم
الجمهور
العلوم / البحث والهندسة
لغة البرمجة
C + +
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/gen3d/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
