هذا تطبيق لينكس iMSAT، وهو متاح للتشغيل عبر الإنترنت، ويمكن تنزيل أحدث إصدار منه بصيغة SSRs.zip. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت من خلال موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى iMSAT عبر الإنترنت لتشغيله في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
سيتم تشغيل iMSAT على Linux عبر الإنترنت
الوصف
يمثل iMSAT تحديثًا كاملاً لبرنامج vcf2MSAT. يسمح برنامج Python لسطر الأوامر هذا للمستخدم باستخدام بيانات تعدد الأشكال التي تم إنشاؤها باستخدام أدوات SAM- و BAM وملف محاذاة .fasta للبحث عن علامات الأقمار الصناعية متعددة الأشكال (MSATs أو STRs). من خلال تحديد صانعي متعدد الأشكال ، بدلاً من مناطق التكرار البسيطة كما فعلت البرامج السابقة ، يزيد iMSAT بشكل كبير من السرعة التي يمكن بها تحديد MSATs متعددة الأشكال - مما يوفر للباحثين الوقت والمال الثمين. يزور http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract لمقالة pdf التي تصف فائدة iMSAT وإذا كنت تستخدم البرنامج ، فيرجى الاستشهاد بهذه المقالة على النحو التالي: Andersen and Mills: iMSAT: نهج جديد لتطوير مواقع الأقمار الصناعية الصغيرة باستخدام مكتبات Illumina المشفرة. علم الجينوم BMC 2014 15: 858.شرح المميزات:
- تحديد السواتل الدقيقة متعددة الأشكال
- تسلسل Illumina
- التحليل الجينومي
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
Python
يمكن أيضًا جلب هذا التطبيق من https://sourceforge.net/projects/imsat/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
