هذا هو تطبيق Linux المسمى Subread للتشغيل في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ subread-2.0.1-source.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى Subread للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
Subread للتشغيل في Linux عبر الإنترنت
Ad
الوصف
حزمة برامج Subread عبارة عن مجموعة أدوات لمعالجة بيانات تسلسل الجيل التالي. يتضمن Subread aligner ، وكاشف تقاطع Subjunc exon-exon ، وبرنامج تلخيص قراءة featureCounts.يمكن استخدام التقويم الفرعي لمحاذاة كل من قراءة gDNA-seq و RNA-seq. تم تحديد محاذاة Subjunc خصيصًا لاكتشاف تقاطع exon-exon. لتعيين قراءات RNA-seq ، يقوم Subread بإجراء محاذاة محلية ويقوم Subjunc بإجراء محاذاة عامة. تم نشر Subread و Subjunc في الورقة التالية: Yang Liao و Gordon K Smyth و Wei Shi. "The Subread aligner: تخطيط قراءة سريع ودقيق وقابل للتطوير عن طريق البذور والتصويت" ، Nucleic Acids Research ، 2013 ، 41 (10): e108
شرح المميزات:
- قراءة التقويم
- تسلسل الجيل القادم
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
C
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/subread/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
