هذا هو تطبيق Linux المسمى Visualization of Protein-Ligand Graphs الذي سيتم تشغيله في Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم vplg_2016_07_18.zip. ويمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى Visualization of Protein-Ligand Graphs للتشغيل في Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
تصور الرسوم البيانية للبروتين ليجند لتشغيلها في Linux عبر الإنترنت
الوصف
تصور حزمة برامج الرسوم البيانية البروتينية (VPLG) يحسب ويصور الرسوم البيانية للبروتين. إنه يعمل على مستوى الهيكل الثانوي الفائق ويستخدم إحداثيات الذرة من ملفات PDB وتخصيصات SSE لخوارزمية DSSP.VPLG هو برنامج سطر أوامر. إذا كنت لا تحب كتابة الأوامر ، فجرب خادم الويب PTGL الخاص بنا: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
شرح المميزات:
- يقرأ بيانات الذرة ثلاثية الأبعاد من ملفات PDB وتخصيصات البنية الثانوية من ملفات DSSP
- يحسب الرسم البياني ليجند البروتين من البيانات ويصور الرسم البياني
- يدعم إخراج صور الرسم البياني بتنسيقات نقطية (.png) ومتجهة (.svg)
- يصدر الرسوم البيانية ليجند البروتين في ملف نصي عادي بتنسيقه الخاص (.plg) الذي يسهل تحريره وتحليله وإنشاءه باستخدام برنامج كمبيوتر وكذلك في عدد من تنسيقات ملفات الرسم البياني القياسية
- يمكن قراءة الرسوم البيانية البروتينية وتصورها مباشرة من ملفات .plg
- البرمجيات الحرة مفتوحة المصدر (FOSS)
- دعم قاعدة البيانات (اختياري تمامًا ، لا يلزم خادم قاعدة البيانات افتراضيًا)
- تسمح واجهة سطر الأوامر بمعالجة الدُفعات بسهولة عبر البرامج النصية للقذيفة
- يسمح بتصفية الروابط حسب العدد الذري
- واجهة مستخدم رسومية جديدة مكتوبة بلغة Java ، لا حاجة لكتابة أوامر وحدة التحكم بعد الآن!
- البرنامج الذي يقوم بتشغيل خادم الويب PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
الجمهور
العلوم / البحث والتعليم والمستخدمين النهائيين المتقدمين
واجهة المستخدم
Java Swing ، وحدة التحكم / المحطة الطرفية ، سطر الأوامر
لغة البرمجة
جافا
بيئة قاعدة البيانات
JDBC.
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/vplg/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
