هذا هو تطبيق Linux المسمى MIPGen والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ mipgen_v15.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى MIPGen مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
لقطات الشاشة:
MIPGen
الوصف:
مولد جهد التفاعل الجزيئي
MIPGEN هو برنامج Python الذي سيحسب شبكات جهد التفاعل الجزيئي
على جزيء معين ، يمكن أن يكون إما بروتينًا أو مركبًا عضويًا صغيرًا (عقار).
سيكون الإخراج عبارة عن سلسلة من الشبكات بتنسيق DX (* .dx) التي سيتمكن المستخدم من القيام بها
للتصور باستخدام أي برنامج تصور جزيئي مثل VMD و PyMol و Chimera ...
لمزيد من المعلومات حول التبعيات والاستخدام ، يرجى قراءة الوثائق.
نرحب بالمستخدمين لنشر أي خطأ أو طلب ضمن قائمة BUGS & REQUESTS. (ستكون هناك حاجة إلى حساب سورس فورج).
المميزات
- إنشاء MIP تلقائي بالكامل بملف PDB بسيط.
- كود مفتوح المصدر. المستخدمون مدعوون للمساهمة في توسيع التحقيقات أو تحسين الكود.
- احسب إمكانات التفاعل الجزيئي القائمة على الشبكة على الببتيدات والأنظمة الجزيئية الأخرى (ربما لا تزال بطيئة للأنظمة الكبيرة)
- احسب MIP على جزيئات صغيرة
- تحقيقات قابلة للتخصيص. نفذ بالفعل: مسعور ، مانح H-Bond ، متقبل H-Bond وتحقيقات كهروستاتيكية.
- التخصيص التلقائي لأنواع الذرة للجزيئات الصغيرة والبروتينات من خلال التفاعل مع غرفة انتظار مفتوحة المصدر و tLeap من حزمة AmbertTools (http://ambermd.org)
الجمهور
العلوم / البحث ، المستخدمون المتقدمون ، المطورون ، المستخدمون النهائيون / سطح المكتب
واجهة المستخدم
وحدة التحكم / المحطة
لغة البرمجة
بايثون
بيئة قاعدة البيانات
سكليتي
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/mipgen/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.