هذا هو تطبيق Linux المسمى SOAPdenovo2 والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم SOAPdenovo2-src-r240.tgz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى SOAPdenovo2 عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
صابوندينوفو 2
الوصف:
ماذا بعد SOAPdenovo2:
MEGAHIT هو الوريث الرسمي لشركة SOAPdenovo2
MEGAHIT: حل فائق السرعة أحادي العقدة لتجميع الميتاجينوميات الكبيرة والمعقدة عبر رسم بياني موجز لـ Bruijn
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
أحدث كود على جيثب:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo هي طريقة تجميع جديدة قصيرة القراءة يمكنها بناء مجموعة مسودة de novo للجينومات ذات الحجم البشري. تم تصميم البرنامج خصيصًا لتجميع قراءات Illumina القصيرة. إنه يخلق فرصًا جديدة لبناء تسلسلات مرجعية وإجراء تحليلات دقيقة للجينومات غير المستكشفة بطريقة فعالة من حيث التكلفة. SOAPdenovo2 هو خليفة SOAPdenovo. استشهد بالورقة المنشورة في GigaScience (انظر الموقع أدناه) إذا كنت تريد الاستشهاد بـ SOAPdenovo2.
الجمهور
العلوم / البحث والمطورين
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
سي ++ ، سي
بيئة قاعدة البيانات
ملف ثابت
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.