هذا هو تطبيق Windows المسمى iCAS - An Illumina Clone Assembly System الذي يتم تشغيله في Windows عبر الإنترنت عبر Linux عبر الإنترنت والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم icas_v062.tar.bz2. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى iCAS - An Illumina Clone Assembly System للتشغيل في Windows عبر الإنترنت عبر Linux عبر الإنترنت باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل أي محاكي لنظام التشغيل OnWorks عبر الإنترنت من موقع الويب هذا ، ولكن أفضل محاكي Windows عبر الإنترنت.
- 5. من نظام التشغيل OnWorks Windows الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته.
- 7. قم بتنزيل Wine من مستودعات برامج توزيعات Linux الخاصة بك. بمجرد التثبيت ، يمكنك النقر نقرًا مزدوجًا فوق التطبيق لتشغيله باستخدام Wine. يمكنك أيضًا تجربة PlayOnLinux ، وهي واجهة رائعة على Wine والتي ستساعدك على تثبيت برامج وألعاب Windows الشائعة.
يعد Wine طريقة لتشغيل برامج Windows على نظام Linux ، ولكن بدون الحاجة إلى Windows. Wine عبارة عن طبقة توافق Windows مفتوحة المصدر يمكنها تشغيل برامج Windows مباشرة على أي سطح مكتب Linux. بشكل أساسي ، يحاول Wine إعادة تنفيذ ما يكفي من Windows من البداية حتى يتمكن من تشغيل جميع تطبيقات Windows دون الحاجة إلى Windows بالفعل.
iCAS - نظام تجميع Illumina Clone للتشغيل في Windows عبر الإنترنت عبر Linux عبر الإنترنت
الوصف:
لا يزال تسلسل الاستنساخ عن طريق الاستنساخ ، كوسيلة لتحقيق تجميعات عالية الجودة للجينومات الكبيرة والمعقدة ، ذا أهمية كبيرة في عصر التسلسل عالي الإنتاجية. ومع ذلك ، فإن التجميعات التي تم الحصول عليها باستخدام مجمعات الجينوم الكاملة الحالية غالبًا ما تكون مجزأة ولديها أحيانًا مشكلات في اكتمال الجينوم بسبب خصائص البيانات المختلفة التي يتم تقديمها بواسطة التسلسل متعدد الإرسال.مع iCAS ، تعتمد عملية تصفية البيانات على خوارزمية جديدة لتردد kmer ، مما ينتج عنه قراءات شبه مثالية للتجميع المسبق. يتم إنشاء Contigs باستخدام خوارزميات تجميع مختلفة ثم يتم دمجها معًا لتحقيق استمرارية أطول. إعادة محاذاة جميع القراءات إلى مسودات contigs وإعادة معايرة كل قاعدة تسلسل تحقق توافقًا نهائيًا. باستخدام النسخ النهائية لمراقبة الجودة ، يكون خط الأنابيب قادرًا على الحصول على مجموعات بتغطية استنساخ تبلغ 99.7٪ وجودة قاعدة إجماع لـ Q39.
تم تطويره في معهد ويلكوم ترست سانجر.
الجمهور
بحث علمي
لغة البرمجة
بيرل ، سي
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/icas/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.