এটি হল অটোডকটুলস কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
adt - AutoDockTools, AutoDock-এর জন্য একটি গ্রাফিক্যাল ফ্রন্ট-এন্ড
সাইনোপিসিস
runAdt [অপশন]
বর্ণনাঃ
এই ম্যানুয়াল পৃষ্ঠাটি প্রদত্ত আউটপুটের প্রায় আক্ষরিক অনুবাদ runAdt -h
কমান্ড।
বিকল্প
বিকল্পগুলির একটি সারাংশ নীচে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে। একটি সম্পূর্ণ বিবরণের জন্য, পড়ুন
টিউটোরিয়াল এবং ডকুমেন্টেশন যা অনলাইনে পাওয়া যায়।
-হ, --help
বিকল্পগুলির সারাংশ দেখান।
-a or --আবার
play back lastlog ফাইল
--ওভাররাইটলগ
লগ ফাইল ওভাররাইট করুন
-- অনন্য লগ
একটি অনন্য নাম দিয়ে একটি লগ ফাইল তৈরি করুন
--নোলগ
লগিং বন্ধ করুন
--নো স্প্ল্যাশ
স্প্ল্যাশ স্ক্রিন বন্ধ করুন
--মরি GUI ইভেন্ট লুপ শুরু করবেন না
-- কাস্টমাইজার ফাইল
ব্যবহারকারীর নির্দিষ্ট ফাইল চালান
--লিব প্যাকেজের নাম
কমান্ডের একটি লাইব্রেরি যোগ করুন
-v r, --দৃষ্টি চালান
কমান্ড লাইনে ভিশন নেটওয়ার্ক চালান
-v o, --দৃষ্টি একদা
ভিশন নেটওয়ার্ক চালান এবং ADT প্রস্থান করুন
-d or --dmode মোড
একটি প্রদর্শন মোড নির্দিষ্ট করুন
মোডগুলি ডিসপ্লে মোডের যেকোনো একটি সংমিশ্রণ হতে পারে
'cpk' : cpk
'লাইন': লাইন
'ss' : সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার রিবন
'sb' : লাঠি এবং বল
'lic' : লিকোরিস
'ms' : আণবিক পৃষ্ঠ
'ca' : সি-আলফা ট্রেস
'bt' : মেরুদণ্ডের চিহ্ন
'sp' : CA-স্প্লাইন
'sssb' : প্রোটিন, লাঠি এবং বলের জন্য গৌণ কাঠামো
বন্ড ছাড়া অন্যান্য অবশিষ্টাংশের জন্য বন্ড লাইন সহ অন্যান্য অবশিষ্টাংশ
-c or --cmode মোড
একটি dispaly মোড রঙের স্কিম নির্দিষ্ট করুন:
'ca': পরমাণু দ্বারা রঙ
'cr' : অবশিষ্টাংশ দ্বারা রঙ (RASMOL স্কিম)
'cc': চেইন দ্বারা রঙ
'cm': অণু দ্বারা রঙ
'cdg': ডেভিড গুডসেলের স্কিম ব্যবহার করে রঙ
'cs' : শেপলি স্কিম ব্যবহার করে রঙের অবশিষ্টাংশ
'css': গৌণ কাঠামো উপাদান দ্বারা রঙ
উদাহরণ:
ফিতা হিসাবে প্রোটিন, লাঠি এবং বল হিসাবে প্রোটিন এবং পরমাণুর প্রকার অনুসারে রঙ প্রদর্শন করুন
adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb
adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে autodocktools ব্যবহার করুন