এটি হল bp_process_sgdp কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
bp_process_sgd.pl - SGD টীকা ফ্ল্যাট ফাইলগুলির জন্য উপযুক্ত সংস্করণে ম্যাসেজ করুন
জেনেরিক জিনোম ব্রাউজার
সাইনোপিসিস
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > yeast.gff
বর্ণনাঃ
এই স্ক্রিপ্টে অবস্থিত SGD সিকোয়েন্স টীকা ফ্ল্যাট ফাইল ম্যাসেজ করে
ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/data_dump/feature/chromosomal_features.tab একটি মধ্যে
জেনেরিক জিনোম ব্রাউজার দ্বারা প্রদর্শনের জন্য উপযুক্ত GFF বিন্যাসের সংস্করণ।
এই স্ক্রিপ্টটি ব্যবহার করতে, তালিকাভুক্ত FTP সাইট থেকে SGD chromosomal_features.tab ফাইলটি পান
উপরে, এবং নিম্নলিখিত কমান্ড চালান:
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > yeast.gff
yeast.gff ফাইলটি নিম্নলিখিত ব্যবহার করে একটি Bio::DB::GFF ডাটাবেসে লোড করা যেতে পারে
কমান্ড প্রয়োগ করুন:
% bulk_load_gff.pl -d yeast.gff
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে bp_process_sgdp ব্যবহার করুন