এটি ম্যাকভিউ কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
ম্যাকভিউ - ম্যাক অ্যালাইনমেন্ট ইনডেক্সার এবং ভিউয়ার
সাইনোপিসিস
maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] in.map [chr,[:শুরু[-শেষ]] [...]]
maqview [-c in.cns] in.map
বর্ণনাঃ
ম্যাকভিউ প্রোগ্রামের একটি সেট যা অ্যালাইনমেন্ট ফাইলে দ্রুত র্যান্ডম অ্যাক্সেস অর্জন করে
` দ্বারা উত্পন্নম্যাক মানচিত্র', এবং একটি চমৎকার GUI (গ্রাফিকাল ব্যবহারকারী
ইন্টারফেস). এটি গতি, মেমরি এবং ডিস্ক ব্যবহারে অত্যন্ত দক্ষ। ম্যাকভিউ উপর ভিত্তি করে
OpenGL এবং ম্যাক ওএস এক্স এবং লিনাক্স উভয় ক্ষেত্রেই কাজ করার জন্য পরিচিত। উইন্ডোজে পোর্টিং নীতিগতভাবে
সহজ।
maqindex
maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] in.map [chr,[:শুরু[-শেষ]] [...]]
-i সারিবদ্ধকরণ ফাইলটি সূচী করুন
-v 'maq ম্যাপভিউ' বিন্যাসে নির্দিষ্ট অঞ্চলে প্রান্তিককরণ মুদ্রণ করুন
-b বাইনারি .map বিন্যাসে নির্দিষ্ট অঞ্চলে প্রান্তিককরণ ডাম্প করুন
-c ফাইল একই সময়ে ম্যাকভিউতে দেখার জন্য Maq কনসেনসাস ফাইলটি সূচী করুন
কার্যক্রম maqindex একটি maq প্রান্তিককরণ ফাইল সূচী করে in.map অথবা দ্রুত সমস্ত পঠিত পুনরুদ্ধার করে
এক বা একাধিক অঞ্চল। অন্যতম -i, -v এবং -b অবশ্যই ব্যবহার করতে হবে. জন্য -v or -b, অন্তত একটা
`chrX', `chrX:1000' বা `chrX:1,000-2,000'-এর মতো অঞ্চল অবশ্যই নির্দিষ্ট করতে হবে। একাধিক অঞ্চল
অনুমতি দেওয়া হয়.
maqview
maqview [-c in.cns] in.map
-c ফাইল Maq ঐক্যমত ফাইল
কার্যক্রম maqview একটি গ্রাফিকাল উইন্ডোতে পঠিত প্রান্তিককরণ প্রদর্শন করে। কখন in.cns is
নির্দিষ্ট করা হয়েছে, শীর্ষ ক্রম হল রেফারেন্স, তারপরে Maq সম্মতি ক্রম;
অন্যথায়, সংখ্যাগরিষ্ঠ-শাসনের ঐকমত্য গণনা করা হবে।
Maqview এর দুটি ভিউ আছে: সিকোয়েন্স ভিউ এবং বক্স ভিউ। সিকোয়েন্স ভিউতে, সিকোয়েন্স পড়ুন
স্ক্রিনে প্রিন্ট করা হবে। গাঢ় ঘাঁটি নিম্ন ভিত্তি গুণাবলী এবং লাল বেশী নির্দেশ করে
রেফারেন্সের তুলনায় পার্থক্য দেখান যদি in.cns নির্দিষ্ট করা হয় বা
সংখ্যাগরিষ্ঠ-শাসন ঐক্যমত না হলে। বক্স ভিউতে, নিউক্লিওটাইড বিভিন্ন ধরনের হয়
A-এর জন্য সবুজ, C-এর জন্য সায়ান, G-এর জন্য কমলা, T-এর জন্য লাল এবং গাঢ় রঙের বক্স হিসেবে উপস্থাপিত
N-এর জন্য ধূসর। রঙের স্যাচুরেশন ভিত্তি গুণাবলী এবং বেধ রেখা নির্দেশ করে
পঠিত সারিবদ্ধকরণের ম্যাপিং গুণাবলী দেখায়। জুম ইন/আউট শুধুমাত্র সমর্থিত
বাক্সের দৃশ্যে। উভয় দৃশ্যে, উইন্ডোর নীচে স্ট্যাটাস বার কিছু দেখাবে
কী স্পর্শ সম্পর্কে তথ্য, এবং মাউস দ্বারা নির্দেশিত নাম এবং মৌলিক গুণাবলী পড়ুন।
প্রান্তিককরণ নেভিগেট বিভিন্ন কী বাইন্ডিং দ্বারা সম্পন্ন করা হয়.
· কী বাইন্ডিং:
? সাহায্য প্রদর্শন করুন
প্রস্থান করুন
সিকোয়েন্স ভিউ
বক্স ভিউ
p পূর্ববর্তী রেফারেন্স সিকোয়েন্সে স্যুইচ করুন
n পরবর্তী রেফারেন্স সিকোয়েন্সে স্যুইচ করুন
রিফ্রেশ
নির্দেশিত অবস্থানে যান
ঘন্টা / একটি বেস দ্বারা বাম সরান
l/ একটি বেস দ্বারা ডান সরান
k/ এক লাইন দিয়ে উপরে যান
জে/ এক লাইন দ্বারা নিচে সরান
> পরবর্তী পাঠে যান
< পূর্ববর্তী পাঠে যান
ছ/ বর্তমান রেফারেন্সের শুরুতে যান
জি/ বর্তমান রেফারেন্সের শেষে যান
আপনি / এক পৃষ্ঠা বামে সরান
/ এক পৃষ্ঠায় ডানদিকে সরান
100টি ঘাঁটি দ্বারা সরান
1000 ঘাঁটি দ্বারা সরান
+ একটি নতুন ভিউ যোগ করুন
- বর্তমান দৃশ্য সরান
ডান অটো-স্ক্রলিং চালু/বন্ধ টগল করুন
^b বাম অটো-স্ক্রলিং চালু/বন্ধ টগল করুন
+ জুম ইন করুন
- ছোট করা
0 ডিফল্ট স্কেলে জুম করুন
q টগল ম্যাপিং গুণাবলী দেখান/লুকান
e প্রদর্শন SE/PE ম্যাপিং গুণাবলী টগল করুন
o একটি নতুন প্রান্তিককরণ ফাইল খুলুন
একটি পূর্ণসংখ্যা লিখুন এবং তারপর টিপুন প্রয়োজনীয় অবস্থানে লাফ দিতে।
একটি পূর্ণসংখ্যা লিখুন এবং তারপরে অন্য একটি কী টিপুন দ্বারা স্ক্রোলিং গতি বাড়াতে
নির্দিষ্ট ফ্যাক্টর।
· বাম ক্লিক করুন এবং ক্রম বরাবর সরানোর জন্য বর্গক্ষেত্রে হলুদ ক্রসটি টেনে আনুন। ঠিক
একটি কলাম হাইলাইট করতে রেফারেন্সে ক্লিক করুন।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে maqview ব্যবহার করুন