প্যালজিস্ট - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

প্যালজিস্ট - একটি লজিস্টিক মডেল ব্যবহার করে জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ সম্পাদন করুন

সাইনোপিসিস

প্যালজিস্ট [ কম্যান্ড-লাইন অপশন ]

বর্ণনাঃ

প্যালজিস্ট একটি দক্ষ উপায়ে বড় অভিযুক্ত ডেটা সেটগুলিতে একটি লিনিয়ার রিগ্রেশন চালায়।

অপশন সমূহ

প্রয়োজনীয় হুকুম লাইন অপশন
-পি, --ফেনো ফাইল
থেকে ফেনোটাইপ ডেটা পড়ুন ফাইল

-আমি, --তথ্য ফাইল
থেকে SNP তথ্য পড়ুন ফাইল (যেমন MLINFO ফাইল)।

-d, --ডোজ ফাইল
SNP ভবিষ্যদ্বাণীকারী (যেমন MLDOSE/MLPROB) ফাইলের নাম।

ঐচ্ছিক হুকুম লাইন অপশন
-মি, --মানচিত্র ফাইল
ম্যাপ ফাইলের নাম, প্রতিটি SNP-এর জন্য বেস পেয়ার পজিশন সহ।

-এন, --নিডস NUMBER টি
বিশ্লেষণ করার জন্য লোকের সংখ্যা।

-গ, --ক্রোম ফাইল
ক্রোমোজোম (আউটপুটে পাস করতে হবে)।

-ও, --আউট ফাইল
আউটপুট ফাইলের নাম (ডিফল্ট হল regression.out.txt ).

-স, --skipd NUMBER টি
ভবিষ্যদ্বাণীকারী (ডোজ/প্রব) ফাইলে কতগুলি কলাম এড়িয়ে যেতে হবে (ডিফল্ট হল 2)।

-টি, -- বৈশিষ্ট্য NUMBER টি
কতগুলি বৈশিষ্ট্য বিশ্লেষণ করা হয় (ডিফল্ট হল 1)।

-জি, --ngpreds NUMBER টি
মার্কার প্রতি কতগুলি ভবিষ্যদ্বাণীকারী কলাম (ডিফল্ট 1 = MLDOSE; অন্যথায় MLPROB-এর জন্য 2 ব্যবহার করুন)।

-এ, -- আলাদা ফাইল
অক্ষর আলাদা ক্ষেত্র (ডিফল্ট হল স্থান)।

-আর, --স্কোর
স্কোর পরীক্ষা ব্যবহার করুন।

-ই, --না-মাথা
আউটপুটে হেডার লাইন রিপোর্ট করবেন না।

-l --allcov
সমস্ত কোভেরিয়েটের জন্য অনুমান রিপোর্ট করুন (বড় আউটপুট!)

-খ, --মিথষ্ক্রিয়া
SNP বিশ্লেষণের সাথে মিথস্ক্রিয়া করার জন্য কোন কোভেরিয়েট ব্যবহার করতে হবে (ডিফল্ট নং
মিথস্ক্রিয়া, 0)।

-কে, --ইন্টারেকশন_শুধুমাত্র
মত --মিথষ্ক্রিয়া কিন্তু SNP-এর সাথে মিথস্ক্রিয়ায় কোভারিয়েট অভিনয় ছাড়াই (ডিফল্ট হল
কোনো মিথস্ক্রিয়া নেই, 0)।

-ভি, --mmscore ফাইল
সংশ্লিষ্ট ব্যক্তিদের নমুনা পরীক্ষা স্কোর. FILE আর্গুমেন্টের নাম a
বিপরীত পারস্পরিক সম্পর্ক ম্যাট্রিক্স সহ ফাইল। উল্লেখ্য যে এই বৈশিষ্ট্যটি এখনও আছে
পরীক্ষামূলক !

--বলিষ্ঠ
শক্তিশালী (ওরফে স্যান্ডউইচ, ওরফে হুবার্ট-হোয়াইট) স্ট্যান্ডার্ড ত্রুটির প্রতিবেদন করুন৷

--help প্রিন্ট সাহায্য.

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে প্যালজিস্ট ব্যবহার করুন