কোয়ালিটিস্কোর - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

কোয়ালিটিস্কোর - সাব-রিড স্যুটের একটি উপাদান

, USAGE

গুণমানের স্কোর [বিকল্প] -i -o

প্রয়োজনীয় যুক্তি:

-i
পঠিত ডেটা সহ ইনপুট ফাইলের নাম। ডিফল্ট ফরম্যাট হল Fastq।

-o
আউটপুট ফাইলের নাম যা প্রতিটি পঠিত বেসের জন্য Phred স্কোর সহ একটি পাঠ্য ফাইল।

ঐচ্ছিক যুক্তি:

--gzFASTQinput ইনপুট ফাইল gzipped Fastq ফরম্যাটে আছে।

--BAMinput
ইনপুট ফাইল BAM ফরম্যাটে আছে।

--স্যামইনপুট
ইনপুট ফাইল SAM ফরম্যাটে আছে।

--প্রথম-শেষ
পেয়ারড-এন্ড ডেটাতে শুধুমাত্র প্রথম পড়া ব্যবহার করুন। শুধুমাত্র পেয়ারড-এন্ড BAM/SAM-এর জন্য প্রযোজ্য
ইনপুট.

--সেকেন্ড-এন্ড
পেয়ারড-এন্ড ডেটাতে শুধুমাত্র সেকেন্ড রিড ব্যবহার করুন। শুধুমাত্র পেয়ারড-এন্ড BAM/SAM-এর জন্য প্রযোজ্য
ইনপুট.

--গণনা-পড়া ইনপুট থেকে নিষ্কাশন করা মোট পঠিত সংখ্যা

ফাইল ডিফল্টরূপে 10,000।

--ফ্রেড-অফসেট <33|64> সাব-রিড অ্যালাইনার উল্লেখ করুন।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে গুণমানস্কোর ব্যবহার করুন