Dies ist der Befehl „rdp-alignment“, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
rdp-alignment: – Paket mit Ausrichtungstools für das Ribosomal Database Project (RDP).
ZUSAMMENFASSUNG
RDP-Ausrichtung
BESCHREIBUNG
Das Alignment-Tools-Paket enthält Befehle zur paarweisen Durchführung definierter Community-Analysen
Ausrichtung und Hidden-Markov-Modell (HMMER3-Modelle, kein Training).
OPTIONAL
Liste von Unterbefehle:
Ausrichtung-Fusion
- Ausrichtungen zusammenführen
paarweise-knn
- Berechnen Sie k-nächste Nachbarn durch paarweise Ausrichtung
Vergleichsfehlertyp
- Erkennen Sie Einfüge-, Lösch- und Substitutionsfehler in Sequenzen im Vergleich zu
Referenzsequenzen
Align-Nucl-to-Prot
- Übertragen Sie ein Sequenz-Alignment von Proteinsequenzen auf Nukleotidsequenzen
rm-partialseq
- Entfernen von Teilsequenzen basierend auf der paarweisen Ausrichtung auf Referenzsequenzen
Nutzen Sie die RDP-Ausrichtung online über die Dienste von onworks.net