xcrysden

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

xcrysden – Visualisierung kristalliner und molekularer Strukturen

ZUSAMMENFASSUNG

xcrysden [Sonderoptionen]
xcrysden [Sonderoptionen] Formatoptionen Datei|Verzeichnis

BESCHREIBUNG

XCrySDen ist ein Programm zur Visualisierung kristalliner und molekularer Strukturen, das darauf abzielt
Darstellung von Isoflächen und Konturen, die kristallinen Strukturen überlagert werden können
und interaktiv gedreht und manipuliert.

SPECIAL OPTIONAL

-h
--help
Hilfemeldung anzeigen.

-v
--Version
Informationen zur Programmversion anzeigen.

-u id
--benutzen id
Laden Sie XCrySDen eingebettet in das Containerfenster mit window-ID=id.

-r schwach
--reducedim schwach
Reduzieren Sie die periodische Dimension der XSF-Datei auf schwach. Muss vorher angegeben werden --xsf Option,
z.B, xcrysden -r 2 --xsf Datei.

-c Datei
--Benutzerdefiniert Datei
Laden Sie benutzerdefinierte Definitionen aus einer angegebenen Datei (die Syntax ist die von
~/.xcrysden/custom-definitions).

-a Datei
--Attribute Datei
Attribute aus Datei laden. Das Format der Attributdatei ist das folgende:

ELEMENTFARBE
Ordnungszahl1 red1 blue1 green1
Ordnungszahl2 red2 blue2 green2
...
ELEMENTRADIUS
Ordnungszahl1 radius1
Ordnungszahl2 radius2
...

-l Datei
--Beleuchtung Datei
Laden Sie Lichtparameter aus der lichtformatierten Datei von XCrySDen.

FORMAT OPTIONAL

--xsf Datei
Laden Sie die Struktur aus einer mit XCrySDen's-Structure-File (XSF) formatierten Datei.

--animxsf Datei
--axsf Datei
Laden Sie Strukturen aus einer mit Animated-XCrySDen's-Structure-File (AXSF) formatierten Datei.

--bxsf Datei
Laden Sie Bänder aus der BXSF-Datei (Band-XSF) und visualisieren Sie die Fermi-Oberfläche.

--xmol Datei
--xyz Datei
Laden Sie die Struktur aus einer XYZ-formatierten Datei.

--pdb Datei
Laden Sie die Struktur aus einer PDB-formatierten Datei.

--gzmat Datei
Laden Sie die Struktur aus der Gaußschen Z-Matrix (erfordert Open-Babel-Programm).

--gaussian_out Datei
--gxx_out Datei
--g98_out Datei
Laden Sie die Struktur aus der Gaußschen Ausgabedatei. Nur Einzelpunktberechnung und
Optimierungslauf wird bisher unterstützt. Für den Optimierungslauf ist es möglich
Rendern Sie alle Strukturen, die während des Laufs erzeugt wurden.

--Würfel Datei
--gXX_cube Datei
--g98_cube Datei
Laden Sie die Struktur aus der Gaußschen Würfeldatei. Die Cube-Datei sollte mit erstellt werden
Option „Würfel=Karten“. Es werden nur Skalar-Cube-Dateien unterstützt, d. h. Cube=(Cards,Density)
oder Cube=(Cards,Orbitals) oder Cube=(Cards,Potential). Weitere Informationen finden Sie im GAUSSIAN-Handbuch
Bedeutung dieser Schlüsselwörter.

--crystal_inp Datei
Ladestruktur aus CRYSTAL (http://http://www.crystal.unito.it/) Eingabedatei.

--crystal_f9 Datei
Ladestruktur aus CRYSTAL (http://http://www.crystal.unito.it/) Fortran-Einheit 9.

--wien_struct Dateikopf|Datei|Verzeichnis
Ladestruktur von WIEN2k (http://www.wien2k.at/) Strukturdatei, wobei:

Dateikopf = Name der Strukturdatei ohne .struct Erweiterung,
Datei = Dateiname,
Verzeichnis = Name des Fallverzeichnisses.

--wien_kpath Verzeichnis|Strukturdatei
Lesen Sie mehr struct Feilen und rendern Sie die erste Brillouin-Zone mit speziellen K-Punkten. K-Pfad kann sein
interaktiv durch Mausklick auf die speziellen k-Punkte ausgewählt werden. Der Benutzer muss angeben EMIN
und EMAX Energien und Gesamtzahl der k-Punkte entlang des Pfades. Diese Zahl ist lediglich
eine Schätzung der Gesamtzahl der k-Punkte, da XCrySDen versucht, sehr einheitlich zu werden
Abtastung von k-Punkten entlang des Pfades (geben Sie nicht die maximal zulässige Anzahl von k-Punkten für WIEN2k an)
Punkte, da XCrySDen möglicherweise ein paar Punkte mehr generiert).

--wien_renderdensity Verzeichnis
Lesen Sie mehr struct, Möglichkeiten für das Ausgangssignal:sowie rho Dateien und rendern kristalline Struktur und vorberechnet
Ladungsdichte.

--wien_density Verzeichnis
Entweder der 2D- oder der 3D-Bereich für die Ladungsdichteberechnung wird interaktiv ausgewählt
Mausklick. XCrySDen generiert in5 Datei(en), berechnet und rendert die Ladungsdichte
entweder als Isolinien/Farbebenen (2D) oder Isoflächen (3D).

--wien_fermisurface Verzeichnis
Öffnen Sie ein Aufgabenfenster für die Erstellung der Fermi-Oberfläche. Nach mehreren Schritten wird der Fermi
Die Oberfläche wird (hoffentlich) als 3D-Isooberfläche gezeichnet.

--fhi_inpini Datei
Laden Sie die Struktur von FHI98MD inp.ini formatierte Datei.

--fhi_coord Datei
Laden Sie die Struktur von FHI98MD koord.out formatierte Datei.

--pwi
--pw_inp Datei
Struktur laden von pw.x Varianten des Eingangssignals: Datei. pw.x ist ein Pseudopotential-Planewave-Programm von
die Quantum-ESPRESSO-Verteilung (http://www.quantum-espresso.org/).

--pwo
--pw_out Datei
Struktur laden von pw.x Möglichkeiten für das Ausgangssignal: Datei. pw.x ist ein Pseudopotential-Planewave-Programm von
die Quantum-ESPRESSO-Verteilung (http://www.quantum-espresso.org/).

-s Skript
--Skript Skript
Laden Sie das Skript aus der Datei, die das Tcl-Skript enthält.

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