Dies ist die Linux-App namens Pathoscope, deren neueste Version als pathoscope_2.0.6_clinical_pathoscope_1.0.3.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Pathoscope mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Pathoskop
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BESCHREIBUNG
Diese Seite dient der Archivierung. Bitte besuchen Sie github für die neueste Version der Software: https://github.com/pathoscopePathoScope nimmt Next-Generation-Sequencing-Reads aus einer Mischprobe und sagt voraus, welche Genome vorhanden sind. Wir verwenden ein Bayes-Framework in Kombination mit einem anfänglichen referenzbasierten Alignment, um Reads dem richtigen Ursprungsgenom zuzuordnen.
Pathoskop 2.0:
Wiki:
http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/Home/
Tutorial:
http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoscope2.0_v0.02_tutorial.pdf
Version des klinischen Pathoskops: http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/clinical_pathoscope/
PathoQC-Download: http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
Veröffentlichungen: http://www.microbiomejournal.com/content/2/1/33
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/262
http://genome.cshlp.org/content/23/10/1721
Kundendienst:
PS: Bei Fragen bitte eine E-Mail an mani2012 at bu dot edu senden.
Eigenschaften
- PathoQC: PathoQC ist ein eigenständiges Programm zur Qualitätskontrolle und Vorverarbeitung für einen Datensatz mit hohem Durchsatz. Bitte laden Sie PathoQC herunter von http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
- PathoQC-Publikation: http://la-press.com/article.php?article_id=4828
- Kundendienst: https://groups.google.com/d/forum/pathoscope
- Laborseite: http://jlab.bu.edu/software/
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/pathoscope/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
