Este es el comando dotmatchere que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
dotmatcher: dibuja una gráfica de puntos de umbral de dos secuencias
SINOPSIS
emparejador de puntos -una secuencia secuencia -bsecuencia secuencia [-archivomatriz matriz]
[-tamaño de ventana entero] [-umbral entero] -estirarse palanca -grafico gráfica
-xígrafo xígrafo
emparejador de puntos -ayuda
DESCRIPCIÓN
emparejador de puntos es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del (los) grupo (s) de comando "Alineación: Gráficos de puntos".
OPCIONES
Entrada .
-una secuencia secuencia
-bsecuencia secuencia
-archivomatriz matriz
Este es el archivo de matriz de puntuación que se utiliza al comparar secuencias. Por defecto es el
archivo 'EBLOSUM62' (para proteínas) o el archivo 'EDNAFULL' (para secuencias nucleicas). Estas
Los archivos se encuentran en el directorio "datos" de la instalación de EMBOSS.
Beneficios adicionales .
-tamaño de ventana entero
Valor predeterminado: 10
-umbral entero
Valor predeterminado: 23
Salida .
-estirarse palanca
Mostrar un gráfico no proporcional Valor predeterminado: N
-grafico gráfica
-xígrafo xígrafo
Utilice dotmatchere en línea utilizando los servicios de onworks.net