Este es el comando fdk que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fdk: reconstrucción de haz cónico a partir de proyecciones utilizando el algoritmo FDK
El término FDK se refiere a los autores Feldkamp, Davis y Kress que escribieron el artículo fundamental
"Práctico algoritmo de haz cónico" en 1984. Su artículo describe una retroproyección filtrada
algoritmo de reconstrucción para geometrías de haz cónico. El programa fdk en plastimatch es un
Implicación del algoritmo FDK.
FDK USO
El programa fdk toma un directorio de imágenes de proyección 2D como entrada y genera un único
Volumen 3D como salida.
El uso de la línea de comando es:
Uso: fdk [opciones]
Opciones:
-Un hardware O "cpu" o "cuda" (predeterminado = cpu)
-a "num ((num) num)" Utiliza este rango de imágenes
-r "r1 r2 r3" Establecer la resolución de salida (en vóxeles)
-f filtro O "ninguno" o "rampa" (predeterminado = rampa)
-s scale Escala la intensidad del archivo de salida
-z "s1 s2 s3" Tamaño físico de la reconstrucción (en mm)
-I indir El directorio de entrada
-O outfile El archivo de salida
El uso del programa fdk se comprende mejor siguiendo los tutoriales:
fdk_tutorial_i y fdk_tutorial_ii.
ENTRADA ARCHIVOS
Se admiten tres formatos diferentes de archivos de entrada. Estos son:
· Archivos de imagen en formato pfm con archivos txt de geometría
· Archivos de imagen de formato sin procesar con archivos txt de geometría
· Archivos hnd de Varian
Los archivos pfm y raw son similares, ya que almacenan la imagen como una matriz de 4 bytes
carrozas little-endian. La única diferencia es que el archivo pfm tiene un encabezado que almacena
el tamaño de la imagen y el archivo sin procesar no.
Cada archivo pfm o de imagen en bruto debe tener un archivo de geometría en el mismo directorio con el .txt
extensión. Por ejemplo, si desea utilizar image_0000.pfm en una reconstrucción, debe
proporcione otro archivo image_0000.txt que contenga la geometría. Una breve descripción de
el formato del archivo de geometría se da en formato_archivo_mat_proj.
La secuencia de archivos debe almacenarse con el patrón:
XXXXYYYY.ZZZ
donde XXXX es un prefijo, YYYY es un número y .ZZZ es la extensión de un tipo conocido
(ya sea .hnd, .pfm o .raw).
Por ejemplo, el siguiente sería un buen diseño de directorio para archivos pfm:
Archivos / image_00.pfm
Archivos / image_00.txt
Archivos / image_01.pfm
Archivos / image_01.txt
etc ...
Los archivos hnd de Varian deben almacenarse en el diseño original. Por ejemplo:
Archivos / ProjectionInfo.xml
Archivos / Scan0 / Proj_0000.hnd
Archivos / Scan0 / Proj_0001.hnd
etc ...
No se necesitan archivos txt de geometría para reconstruir a partir del formato Varian hnd.
IMAGEN GEOMETRÍA
De forma predeterminada, cuando genera una RRD, la imagen se orienta como si la fuente de rayos X virtual
eran una cámara. Eso significa que para una película lateral derecha, las columnas de la imagen van desde
inf a sup, y las filas van de hormiga a publicación. El sistema Varian OBI produce archivos HND,
que están orientados de manera diferente. Para una radiografía lateral derecha, las columnas de las imágenes HND van
de hormiga a poste, y las filas van de sup a inf. Se muestra una ilustración de esta idea.
en la figura siguiente.
[imagen] Geometría de archivos Varian HND. UNINDENT
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