Esta es la aplicación de Linux llamada SW # cuya última versión se puede descargar como swsharp-src.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SW # con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SUDOESTE#
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DESCRIPCIÓN
SW # (swsharp) es una biblioteca para la alineación de secuencias basada en GPU habilitadas para CUDA. Utiliza el algoritmo de Hirschbergs y Ukkonens para mejorar la eficiencia de la memoria y aumentar la velocidad. La biblioteca es escalable para su uso con múltiples GPU. Algunas partes de la biblioteca utilizan MPI para clústeres habilitados para CUDA.Este trabajo ha sido financiado en parte por la Fundación de Ciencias de Croacia en el marco del proyecto UIP-11-2013-7353.
¡Búsqueda de base de datos ahora disponible!
Publicaciones:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
Trabajo relacionado:
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
NUEVO:
Edición web SW #:
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/swsharp/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
