Esta es la aplicación de Linux llamada iPiG cuya última versión se puede descargar como ipig_r5.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada iPiG con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
iPiG
DESCRIPCIÓN:
iPiG apunta a la integración de coincidencias de espectro de péptidos (PSM) de espectrometría de masas (MS)
identificaciones de péptidos en visualizaciones genómicas proporcionadas por el navegador del genoma, como el navegador del genoma UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
iPiG toma PSM del formato estándar de MS mzIdentML (* .mzid) o en formato de texto y proporciona resultados en formatos de seguimiento del genoma (archivos BED y GFF3), que se pueden importar fácilmente a los navegadores del genoma.
Para obtener más detalles sobre iPiG y su funcionalidad, consulte
"iPiG: Integración de coincidencias de espectro de péptidos en visualizaciones del navegador del genoma"
Mathias Kuhring y Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Java Swing, consola / terminal
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/ipig/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.