Esta es la aplicación de Linux llamada SASHIMI cuya última versión se puede descargar como TPP_Setup_6.3.3.exe. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SASHIMI con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
SASHIMIA
DESCRIPCIÓN:
El proyecto Sashimi alberga Trans-Proteomic Pipeline (TPP), un conjunto maduro de herramientas para proteómica basada en especificaciones de masas (MS, MS/MS): validación estadística, cuantificación, visualización y convertidores de datos de MS sin procesar al mzML abierto. formatos mzXML.
Caracteristicas
- Motores de búsqueda de bases de datos (cometa, etc.)
- SpecraST (motor de búsqueda de la biblioteca de espectros)
- Búsqueda masiva abierta (Magnum, etc.)
- Kojak (Búsqueda de enlaces cruzados)
- Análisis DDA
- DISCo (Análisis DIA)
- reSpect (Análisis de espectro quimérico)
- Cuantificación de MS1 y MS2 con y sin etiqueta
- Generación de base de datos señuelo
- PeptideProphet (validación de nivel de PSM)
- iProphet (validación del nivel de péptidos)
- PTMProphet (Validación de modificación postraduccional)
- Validación del nivel de proteína
- Generación de bibliotecas de espectro
- Herramientas de visualización de datos
- Predicción y catalogación del tiempo de retención
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comandos basada en web
Lenguaje de programación
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/sashimi/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.