Esta es la aplicación de Linux llamada Seqshell cuya última versión se puede descargar como start.jar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Seqshell con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Seqshell
DESCRIPCIÓN:
Combina las funciones Tophat y Cuffdiff en una interfaz GUI. Se requiere que el tophat y el cuffdiff estén preinstalados en el sistema.
Al modificar el programa, se puede usar para ejecutar cualquier programa de línea de comando, incluso paquetes de R, ya que R también se puede ejecutar desde líneas de comando.
Nuevas funciones:
Función de procesamiento por lotes para Tophat. Ahora puede ejecutar tantos trabajos de mapeo como desee con tophat. Este programa guardará la salida en carpetas separadas.
Se enviará un correo electrónico de alerta a su dirección de correo electrónico cuando el trabajo esté terminado. (Deberá modificar el código fuente para cambiar el contenido para satisfacer sus necesidades especiales)
La información del tiempo de ejecución se mostrará en una ventana de salida de JAVA.
Audiencia
Desarrolladores, usuarios finales / escritorio
Interfaz de usuario
Swing de Java
Lenguaje de programación
Java
Categorias
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/seqshell/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.