Esta es la aplicación de Windows llamada FastQC cuya última versión se puede descargar como v0.12.1sourcecode.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FastQC con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
CAPTURAS DE PANTALLA:
Control de calidad rápido
DESCRIPCIÓN:
FastQC es una herramienta de análisis de control de calidad diseñada para detectar problemas potenciales en conjuntos de datos de secuenciación de alto rendimiento. Su objetivo es proporcionar una forma sencilla de verificar la calidad de los datos de secuencia sin procesar que provienen de procesos de secuenciación de alto rendimiento. Lo hace ejecutando un conjunto modular de análisis en uno o más archivos de secuencia sin procesar en formato fastq o bam. Luego produce un informe que resume los resultados y destaca las áreas en las que la biblioteca puede parecer inusual. Esto debería indicarle dónde sus datos pueden tener problemas y permitirle tomar las medidas necesarias para corregirlos antes de realizar más análisis.
FastQC no está vinculado a ningún tipo específico de técnica de secuenciación, por lo que se puede usar para buscar bibliotecas de varios tipos de experimentos (secuenciación genómica, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq, etc.).
Caracteristicas
- Importa datos de archivos BAM, SAM o FastQ
- Ofrece una descripción general rápida que destaca las áreas problemáticas potenciales
- Gráficos y tablas de resumen para una evaluación rápida de los datos
- Exportar resultados a HTML
- Se puede utilizar sin conexión
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.