Esta es la aplicación de Windows llamada misc genomics tools cuya última versión se puede descargar como misc_genomics_tools_v0.2.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada herramientas misceláneas de genómica con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
CAPTURAS DE PANTALLA:
herramientas misceláneas de genómica
DESCRIPCIÓN:
Esta es una colección de varios programas desarrollados en el curso de un proyecto de genómica, que involucra la cepa de Pseudomonas NCIMB10586
Estas incluyen
* identificar y corregir errores en una (p. ej.) secuencia del genoma de pacbio utilizando lecturas de illumina
* secuencia procariótica/anotación del genoma
* Análisis RNAseq: normalización y recopilación de múltiples muestras como grupo
* Visualización de RNAseq
Todas las secuencias de comandos se proporcionan según el "mejor esfuerzo", sin embargo, debido a varios cambios en el sistema, no garantizo que todos los archivos sean de la versión utilizada en el análisis.
Además, tenga en cuenta que estos se desarrollaron teniendo en cuenta la conveniencia, es decir, se esperaba que el proceso se realizara en su forma final una vez; se prestó poca atención a la optimización del tiempo de ejecución o al encadenamiento de scripts, y en ocasiones se accede manualmente a los recursos externos.
Caracteristicas
- Corrección de errores de secuencia del genoma
- Anotación de secuencia procariótica
- Normalización de RNAseq de múltiples muestras como grupo
- Serie de muestras de RNAseq/visualización del transcurso del tiempo
Público
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.