این دستور demux است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
demux - محدودیت های فاصله XPLOR را به فرمت Gromacs تبدیل کنید
خلاصه
دیوکس md0.log اضافی
شرح
اگر می خواهید دوباره مسیرهای خود را پیوسته کنید، می توانید استفاده کنید دیوکس خواندن
فایل md0.log خود را (در صورت لزوم می توانید چندین را به هم متصل کنید) و چند خروجی تولید کنید
فایل ها. یکی از اینها فایل xvg.replica_ndx.xvg) که می توان به آن منتقل کرد trjcat(1) در امتداد
با فایل های مسیر اصلی، به منظور تولید مسیرهای پیوسته. دیگری
فایل (replica_temp.xvg) شامل دماهای هر ماکت است که از درجه شروع می شود
دمای اصلی بنابراین اگر کپی مورد علاقه شما مثلاً از 300 K شروع می شود، می توانید دنبال کنید
مسیر آن از طریق فضای دما جالب است که مقداری اضافه کنیم
قابلیت ایجاد هیستوگرام از توزیع دما برای هر ماکت، که
طبق نظر اکثر نویسندگان، باید صاف باشد. می توان از مسیرهای دموکس شده استفاده کرد
g_kinetics(1) برای به دست آوردن سینتیک تاشو پروتئین از مسیرهای REMD.
OPTIONS
md0.log فایل گزارش مسیری که می‌خواهید پیوسته بسازید. چندین فایل می تواند باشد
به هم پیوست
اضافی تعداد دفعاتی که هر ورودی در فایل گزارش کپی می شود. (عدد صحیح)
محدودیت ها
اگر مبادله شما هر N ps بود و هر M ps را ذخیره کردید، می توانید از دست رفته را جبران کنید
فریم ها با تنظیم اضافی به (N/M - 1). اگر N/M عدد صحیح نباشد، شانس شما را ندارید و شما
به هیچ وجه نمی تواند مسیرهای شما را دموکس کند.
با استفاده از خدمات onworks.net از demux آنلاین استفاده کنید