kmc_tools-union - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

kmc_tools-union - اتحاد دو پایگاه داده KMC را محاسبه کنید

خلاصه

kmc_tools اتحادیه

شرح

پایگاه داده خروجی شامل تمام k-mer های موجود در هر دو مجموعه ورودی خواهد بود. برای همین
k-mers در ورودی اول و دوم، شمارنده در خروجی برابر با مجموع است
از هر دو ورودی

OPTIONS

برای هر ورودی پارامترهای اضافی وجود دارد:

-ci
k-merهایی را که کمتر از آن رخ می دهند را حذف کنید بار

-cx
k-merهایی را که بیشتر از آن رخ می دهند را حذف کنید بار

برای خروجی پارامترهای اضافی وجود دارد:

-ci
k-merهایی را که کمتر از آن رخ می دهند را حذف کنید بار

-cx
k-merهایی را که بیشتر از آن رخ می دهند را حذف کنید بار

-cs
حداکثر مقدار یک شمارنده

مثال

kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp kmc_tools union kmers1
-ci3 -cx70000 kmers2 kmers1_kmers2_union -cs65536

از kmc_tools-union به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید