این برنامه لینوکس به نام Digital Expression در وب برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان dew_RC2.tar.bz2 دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه را به نام Digital Expression در وب به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا در لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks به صورت رایگان اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
Digital Expression در وب برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
Ad
شرح
DEW پلتفرمی است که به کاربران امکان می دهد داده های RNA-Seq را کاوش کنند. یک رابط کاربری گرافیکی مبتنی بر وب گنجانده شده است.تجزیه و تحلیل به این صورت پیش می‌رود: هم‌ترازی‌های شکاف انجام شده و برای طول، PCR و بایاس قطعه تصحیح می‌شوند، به طوری که یک قطعه در هر کیلو باز (موثر) در هر میلیون خواندن (FPKM) و همچنین خواندن ساده‌تر در هر کیلوبایت در هر میلیون خواندن تخمین زده می‌شود. RPKM). هنگامی که با ایزوفرم های متعدد و در حالت "متن" ارائه می شود، اصلاحات شامل الگوریتم به حداکثر رساندن انتظار می شود که پروفایل های بیان موثر را تخمین می زند و یک تراز اصلاح شده تولید می شود. برای هر ژنی که کاربر ارائه می‌کند، DEW آمار توصیفی پوشش (RPKM، FKMP و تعداد کل، میانگین و میانه تعداد تصحیح شده)، پروفایل‌های بیان (به‌عنوان R/FPKM عادی شده و میانگین تغییر برابری کاهش یافته) را محاسبه می‌کند. DEW به کاربران اجازه می دهد تا داده ها را با ارائه نمودارهای تعاملی کاوش کنند.
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
مبتنی بر وب
زبان برنامه نویسی
پرل، جاوا اسکریپت، S/R
محیط پایگاه داده
از SQLite
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/dew/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
