این برنامه لینوکس است که به صورت آنلاین در لینوکس اجرا می شود و آخرین نسخه آن را می توان با عنوان came-0.0.1.jar دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
دانلود و اجرای آنلاین این برنامه به نام به صورت رایگان در لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks اجرا می شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
به صورت آنلاین در لینوکس اجرا شد
DESCRIPTION:
دسترسی کروماتین نقش کلیدی در تنظیم اپی ژنتیکی فعال سازی و خاموش شدن ژن ایفا می کند. نواحی کروماتین باز به عناصر تنظیمی مانند فاکتورهای رونویسی و پلیمرازها اجازه می دهد تا برای بیان ژن متصل شوند در حالی که مناطق کروماتین بسته از فعالیت ماشین های رونویسی جلوگیری می کنند. اخیراً، اشغال نوکلئوزومی و توالی‌یابی متیلوم (NOMe-seq) برای پروفایل‌سازی همزمان دسترسی کروماتین و متیلاسیون DNA روی مولکول‌های منفرد ایجاد شده است. با این حال، هیچ روش محاسباتی برای تجزیه و تحلیل داده های NOMe-seq وجود ندارد.نتایج: در این مقاله، ما CAME، یک رویکرد مبتنی بر بسط بذر را ارائه می‌کنیم که دسترسی کروماتین را از NOMe-seq شناسایی می‌کند. کارایی و اثربخشی CAME از طریق مقایسه با سایر تکنیک‌های موجود بر روی داده‌های شبیه‌سازی شده و واقعی نشان داده شد و نتایج نشان می‌دهد که روش ما نه تنها می‌تواند دسترسی کروماتین را دقیقاً شناسایی کند، بلکه از سایر روش‌ها نیز بهتر عمل می‌کند.
مخاطبان
کاربران نهایی / دسکتاپ
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
جاوه
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/came/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.