این برنامه لینوکس با نام dataMAPPs برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان dataMAPPs_3.2.7.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
دانلود و اجرا آنلاین این برنامه به نام dataMAPPs برای اجرا در لینوکس آنلاین با OnWorks به صورت رایگان.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
اسکرین شات ها:
dataMAPP ها برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
DESCRIPTION:
dataMAPPs امکان پردازش معمول و کارآمد داده‌های حاصل از مطالعات ایمنی‌زایی را با استفاده از فناوری پپتیدومیکس MAPPs برای شناسایی اپی توپ‌های بالقوه MHCI- یا MHC-II که توسط سلول‌های دندریتیک (DC) ارائه می‌شود، می‌دهد.این ویژگی کنترل کیفیت داده‌های خام، نرمال‌سازی بین نمونه/در سراسر اهداکننده و تجسم نتایج در سبک نقشه حرارتی (HeatMAPP) است. هسته dataMAPPs یک کتابخانه R عمومی است که می تواند از طریق اسکریپت های کنترلی اختصاصی برای پروژه های خاص تنظیم شود که همچنین امکان محاسبه مجدد نتایج را فراهم می کند.
برای دستورالعمل های نصب و استفاده با فایل README مشورت کنید. اسناد بیشتر در قالب PDF ارائه شده است.
dataMAPPs تحت مجوز GPL توسط تیمی از دانشمندان که برای Hoffmann-La Roche AG در بازل، سوئیس کار می کنند، منتشر شده است. این نرم افزار همانطور که هست ارائه شده است تا به نفع سایر محققین باشد.
انتشار در حال آماده سازی:
اشتاینر و همکاران، "فعال کردن پروتئومیکس پپتیدی مرتبط با MHC-II روتین (MAPPs) برای ارزیابی خطر ایمنی زایی ناشی از دارو"
امکانات
- واردات داده‌های پپتیدومیکس (خروجی PEAKS، اما ممکن است تمدید شود)
- QC داده های گسترده و حذف نمونه توسط برش های قابل تعریف توسط کاربر
- روش عادی سازی 2 مرحله ای اختصاصی برای داده های MAPP
- نقشه برداری پپتیدها برای هدف قرار دادن آنتی بادی/پروتئین
- خوشه‌بندی موقعیت‌های نقشه‌برداری پپتید در مناطق اپی‌توپ کانون
- تجسم نتایج نقشه برداری به عنوان نقشه های حرارتی
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول / ترمینال
زبان برنامه نویسی
S / R
محیط پایگاه داده
فایل مسطح
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/datamapps/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.