این برنامه لینوکس به نام TomoJ است که آخرین نسخه آن را می توان با نام TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام TomoJ را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
TomoJ
DESCRIPTION:
TomoJ یک افزونه ImageJ برای بازسازی توموگرافی است.
این برای توموگرافی الکترونی طراحی شده است، با این حال هر گونه اکتساب با پرتو موازی باید کار کند.
TomoJ پیش پردازش و ثبت سری های شیب را قبل از بازسازی های سه بعدی (WBP، ART، SIRT، OS-SART، سنجش فشرده) پیشنهاد می کند.
TomoJ به زبان جاوا نوشته شده است، محاسبات چند رشته ای هستند و بازسازی را می توان روی CPU یا GPU (OpenCL) انجام داد.
ثبت نام در شرح زیر است:
مجله زیست شناسی ساختاری: X. 2020، جلد 4. "بهبود تراز کردن تصاویر بدون نشانگر برای توموگرافی الکترونی" COS Sorzano et al. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC بیوانفورماتیک. 2009 آوریل 27؛ 10:124 "ثبت تصویر بدون نشانگر سری تیلت توموگرافی الکترونی." COS Sorzano و همکاران.
قسمت بازسازی در شرح داده شد:
BMC بیوانفورماتیک. 2007 اوت 6؛ 8:288. "TomoJ: نرم افزار توموگرافی برای بازسازی سه بعدی در میکروسکوپ الکترونی عبوری." مسعودی سی و همکاران
امکانات
- توموگرافی
- ImageJ
- تراز سری Tilt
- بازسازی سه بعدی
- WBP
- ART
- SIRT
- فشرده سازی
رابط کاربری
جاوا Swing
زبان برنامه نویسی
جاوا، OpenCL
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/tomoj/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.