Il s'agit de la commande cpgreporte qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
cpgreport - Identifier et signaler les régions riches en CpG dans la ou les séquences nucléotidiques
SYNOPSIS
rapport cp -séquence suite -But entier -fichier de sortie fichier de sortie -défaite s'abattre
rapport cp -Aide
DESCRIPTION
rapport cp est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open
suite logicielle"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Nucleic:CpG Islands".
OPTIONS
Entrée
-séquence suite
Requis
-But entier
Cela définit le score pour chaque séquence CG trouvée. Une valeur de 17 est plus sensible, mais
28 a également été utilisé avec un certain succès. Valeur par défaut : 17
Sortie
-fichier de sortie fichier de sortie
-défaite s'abattre
Fichier pour les caractéristiques de sortie
Utilisez cpgreporte en ligne en utilisant les services onworks.net