Il s'agit de l'application Linux nommée Autoprime à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom autoprime.2.1.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Autoprime pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Autoprime pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
AutoPrime permet de concevoir rapidement des amorces pour la mesure PCR en temps réel de l'expression eucaryote.En se connectant à la base de données EnsEMBL, les informations sur la structure des gènes sont utilisées pour trouver des amorces couvrant les frontières des exons. De cette façon, seules les séquences exprimées sont capturées. De plus, les erreurs d'amorçage sur les régions répétitives peuvent être évitées en utilisant les informations de RepBase.
Features
- Conception d'amorces automatisée
- Contrôle qualité grâce à des réglages détaillés
- En utilisant des sources connues : Primer3, EnsEMBL, RepBase
- Création de vos amorces depuis 2003
- Site Web fonctionnant en tant que service
- Code Perl disponible pour une exécution locale
Audience
Science/Recherche, Utilisateurs finaux avancés
Interface utilisateur
Basé sur le Web, ligne de commande
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/autoprime/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
