Il s'agit de l'application Linux nommée Bio::NEXUS à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Bio-NEXUS-0.78.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Bio::NEXUS pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Bio::NEXUS pour fonctionner sous Linux en ligne
Ad
DESCRIPTION
Si vous gérez des données phylogénétiques, Bio::NEXUS peut vous faciliter la vie avec une bibliothèque et des outils prêts à l'emploi pour manipuler et visualiser les fichiers NEXUS (voir http://www.molevol.org/nexplorer et http://search.cpan.org/dist/Bio-NEXUS/doc/Tutorial.pod).Features
- facile à installer : perl -MCPAN -e 'install Bio::NEXUS'
- manipuler les données dans les fichiers NEXUS à l'aide d'un outil en ligne de commande (nextool.pl)
- écrire un script personnalisé pour sélectionner (exclure) les OTU de la matrice ET de l'arbre
- écrire un script personnalisé pour re-rooter un arbre (ou mille arbres à la fois)
- générer une image PS évolutive des données et de l'arbre (nexplot.pl)
Audience
Développeurs, Autre public, Science/Recherche
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/bionexus/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
