Il s'agit de l'application Linux nommée chemfiles à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée en tant que version 0.8.0.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée chemfiles pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
chemfiles à exécuter sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Chemfiles est une bibliothèque moderne et de haute qualité pour la lecture et l'écriture de fichiers de trajectoire créés par le programme de simulations de chimie computationnelle. Ces trajectoires contiennent des positions atomiques, des vitesses, des noms, une topologie et parfois plus.Les simulations en cours produisent d'énormes quantités de données, qui doivent être post-traitées pour extraire des informations physiques sur le système simulé. Chemfiles fournit une interface pour accéder à ces informations qui est
- unifié : le même code fonctionnera avec tous les formats supportés ;
- simple : l'interface est simple d'utilisation et largement documentée.
Ceci n'est qu'un miroir du référentiel principal, le développement des fichiers chimiques se fait sur Github, à https://github.com/chemfiles/chemfiles/
Comment ça marche
- Lire les formats de fichiers texte (XYZ, PDB, ...) et binaire (NetCDF, TNG, ...) ;
- Filtrez les atomes avec un langage de sélection riche ;
- Soutenir un nombre variable d'atomes dans des trajectoires;
- Définir une cellule unitaire ou une topologie personnalisée lors de la lecture/écriture ;
- Interface de programmation facile à utiliser en Python, C++, C, Fortran 95, Julia et Rust ;
- Multiplateforme, utilisable sous Linux, OS X et Windows.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/chemfiles/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
