Il s'agit de l'application Linux nommée CoVEC à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom covec_distribution-v0.4.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CoVEC pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CoVEC pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Le package fournit des modèles SVM à utiliser avec SVMlight (http://svmlight.joachims.org/) pour dégager un consensus sur les prédictions individuelles de tiers sur l'effet des mutations. Les outils tiers sont SIFT, Polyphen3, SNPs&GO et Mutation Assessor.Le package fournit également une série de modules et de scripts Perl pour aider à la préparation des données. Les modules peuvent être utilisés pour créer des outils et des pipelines personnalisés, tandis que les scripts fournissent des implémentations exécutables de base basées sur les modules.
SVMlight, SIFT, Polyphen2, SNPs&GO et Mutation Assessor sont la propriété de leurs auteurs et institutions respectifs et ne sont pas distribués dans ce package.
Audience
Industrie de la santé, Science/Recherche, Développeurs
Interface utilisateur
Console/Terminal, ligne de commande
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/covec/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
