Il s'agit de l'application Linux nommée dna-bison à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de bison-0.3.3.tgz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée dna-bison pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
dna-bison pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Bison permet aux utilisateurs ayant accès à un cluster d'ordinateurs d'aligner rapidement le séquençage au bisulfite du génome entier ou les lectures RRBS. Il peut aligner les bibliothèques directionnelles et non directionnelles et utilise bowtie2.Plusieurs nœuds de calcul ne sont pas absolument nécessaires, mais accéléreront le processus d'alignement.
Plus de détails disponibles sur la page Wiki. Aide également disponible sur SEQanswers (http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=31314) ou en créant un ticket ici.
Vous pouvez maintenant suivre le développement sur github (https://github.com/dpryan79/bison).
Il y a maintenant un tutoriel disponible dans les téléchargements ici : http://sourceforge.net/projects/dna-bison/files/bison_tutorial.tar.gz/download .
Audience
Industrie de la santé, Science/Recherche, Utilisateurs finaux avancés
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/dna-bison/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
