Il s'agit de l'application Linux nommée ExAM-Exome_Analysis_And_Mining à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom ExAM-1.5.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée ExAM-Exome_Analysis_And_Mining pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
ExAM-Exome_Analysis_And_Mining à exécuter sous Linux en ligne
Ad
DESCRIPTION
Au cours des dernières années, le séquençage de l'exome entier s'est imposé pour la recherche génétique, en grande partie en raison de son utilisation pour la détection de mutations causales responsables de troubles mendéliens. En raison de leur puissance et du coût rapidement décroissant de ces technologies, une quantité massive de données de séquençage de l'exome est générée et devient accessible à une communauté de scientifiques de plus en plus large. Cependant, ces données restent difficiles à analyser et à interpréter par la communauté scientifique en général, en raison des ressources bioinformatiques limitées actuellement disponibles gratuitement pour leur analyse et des informations partielles qu'elles fournissent. Ici, nous présentons un package d'analyse interactif et gratuit, ExAM, dédié à l'analyse des données de séquençage de l'exome entier. Il est accessible aux non-informaticiens et fournit un ensemble complet d'informations, ainsi qu'une aide à la décision pour hiérarchiser les variantes causant des maladies candidates.Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Système de fenêtre X (X11)
Langage de programmation
Python, C
Environnement de base de données
MySQL
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/exam-exome-analysis-and-mining/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
