Il s'agit de l'application Linux nommée SOAPsv à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom AsmSV.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée SOAPsv pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SOAPsv pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Il s'agit d'une approche qui complète les méthodes précédentes pour une identification fiable des variations structurelles homozygotes. Notre approche détermine avec précision le génotype et les points de rupture par rapport à un génome de référence basé sur l'assemblage de novo des données de séquençage d'Illumina Genome Analyzer. Dans cette méthode, nous avons examiné uniquement les variations structurelles homozygotes car la détection des variations structurelles hétérozygotes nécessite l'assemblage de séquences d'haplotypes, ce qui n'est pas encore possible avec les assembleurs existants.Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
AWK, C++, Perl, Shell Unix
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/soapsv/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
