Il s'agit de l'application Linux nommée Allelome.PRO à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Allelome_PRO.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Allelome.PRO pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
Ad
Allelome.PRO pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
La détection des biais alléliques à partir des données de séquençage à haut débit nécessite une approche qui maximisesensibilité tout en minimisant les faux positifs. Nous présentons ici Allelome.PRO, un logiciel convivial automatisé
pipeline bioinformatique, qui utilise des données de séquençage à haut débit provenant de croisements réciproques
de deux souches de souris génétiquement distinctes pour détecter l'expression et la chromatine spécifiques d'un allèle
modifications. Allelome.PRO étend les approches utilisées dans les études précédentes qui ont exclusivement analysé
expression imprimée pour donner une image complète de "l'allélome" en catégorisant automatiquement les
expression allélique de tous les gènes dans un type cellulaire donné en bialléliques ou non informatifs imprimés, biaisés par la souche.
Allelome.PRO offre une sensibilité accrue pour analyser les transcrits faiblement exprimés, ensemble
avec un taux de fausses découvertes robuste calculé empiriquement à partir de la variation des données de séquençage.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Shell Unix, Perl, S/R
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/allelomepro/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
